中國熱帶農業科學院環境與植物保護研究所岳政府獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中國熱帶農業科學院環境與植物保護研究所申請的專利一種宏基因組數據集的生物地球化學元素循環分析方法及系統獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119580852B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-26發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202411653970.1,技術領域涉及:G16B50/10;該發明授權一種宏基因組數據集的生物地球化學元素循環分析方法及系統是由岳政府;鄒雨坤;盛壽山;寇枘;張靜;張菁;彭梁;許偉;楊霞;李勤奮設計研發完成,并于2024-11-19向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種宏基因組數據集的生物地球化學元素循環分析方法及系統在說明書摘要公布了:本發明公開了一種宏基因組數據集的生物地球化學元素循環分析方法及系統,包括:獲取原始實驗數據,基于原始實驗數據獲得注釋文件、樣本分組文件與非冗余基因組概況文件;對注釋文件、樣本分組文件與非冗余基因組概況文件進行預處理,獲得樣本數據集;構建化學元素循環分析模型,基于樣本數據集與化學元素循環分析模型獲得化學元素的剖面文件;將化學元素的剖面文件按照所對應的實驗處理條件進行分類整理,對每個分類進行統計分析后進行可視化處理,并存儲統計分析結果與可視化處理結果。當用戶需要對龐大的宏基因組數據集進行分析時,使用戶能夠全面、快速、靈活地獲取到直觀的微生物的相關信息。
本發明授權一種宏基因組數據集的生物地球化學元素循環分析方法及系統在權利要求書中公布了:1.一種宏基因組數據集的生物地球化學元素循環分析方法,其特征在于,包括: 獲取原始實驗數據,基于原始實驗數據獲得注釋文件、樣本分組文件與非冗余基因組概況文件;對所述注釋文件、所述樣本分組文件與所述非冗余基因組概況文件進行預處理,獲得樣本數據集; 獲得注釋文件的過程包括: 對所述原始實驗數據進行組裝,對組裝的長序列片段進行基因預測,并翻譯得到氨基酸序列;將所述氨基酸序列與KEGG數據庫和NR數據庫進行比較,獲得對應的KO條目,基于KO條目對所述氨基酸序列進行功能注釋和分類注釋,獲得注釋文件; 構建化學元素循環分析模型,基于所述樣本數據集與所述化學元素循環分析模型獲得化學元素的剖面文件; 所述化學元素循環分析模型包括四個循環分析分支,分別對應按照碳、氮、磷、硫四個化學元素; 基于所述樣本數據集與所述化學元素循環分析模型獲得化學元素的剖面文件的過程包括: 整理所述樣本數據集中與對應化學元素循環相關的KO條目,基于所述KO條目提取豐度信息,根據化學元素循環過程對所述豐度信息進行合并,獲得循環豐度數據集; 對所述循環豐度數據集進行正態性檢驗后進行顯著性分析并將分析結果存儲至命名為Heatmap的文件夾;其中,根據原始實驗數據對應實驗條件的種類數量與正態性檢驗結果選擇顯著性分析的方法; 檢查預定義類別的碳循環基因ID,判斷存在的類別;根據存在的類別創建碳循環途徑文件夾,統計不同分類學層次的相關微生物并保存至對應的碳循環途徑文件夾中; 對循環豐度數據集進行β-多樣性分析評估微生物群落的相似性和差異性,對分析結果進行可視化,將可視化結果存儲至與可視化方式相同命名的文件夾中; 將化學元素的剖面文件按照所對應的實驗處理條件進行分類整理,對每個分類進行統計分析后進行可視化處理,并存儲統計分析結果與可視化處理結果。
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