慕恩(廣州)生物科技有限公司張陳陳獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉慕恩(廣州)生物科技有限公司申請的專利一種生物標志物的篩選方法及其相關應用獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN114974432B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-05發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202210770641.X,技術領域涉及:G16B40/00;該發明授權一種生物標志物的篩選方法及其相關應用是由張陳陳;梁雅俊;朱瑞娟;蘭周;常曌;張東亞;蔣先芝設計研發完成,并于2022-06-30向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種生物標志物的篩選方法及其相關應用在說明書摘要公布了:本發明公開了一種生物標志物的篩選方法及其相關應用,涉及生物檢測技術領域。本發明提供了一種篩選生物標志物的方法,無需通過測量儀器對菌株的代謝產物進行檢測,而是直接通過對菌株基因組序列的功能預測來預測每個菌種的代謝產物,并形成代謝產物序列庫,后續利用宏基因組測序數據和菌株序列庫及代謝產物序列庫分別進行比對,計算每個菌種的豐度及每種代謝產物的豐度,然后基于菌種豐度和代謝產物豐度,以及代謝產物和菌種的對應關系,對菌種進行篩選。在未實際測量代謝物的情況下,也能基于菌種和代謝物兩個方面來篩選。顯著降低了開發疾病診斷和療效預測的標志物以及藥物篩選的時間和成本,為疾病機制的研究和藥物開發提供了新途徑。
本發明授權一種生物標志物的篩選方法及其相關應用在權利要求書中公布了:1.一種微生物標志物的篩選方法,其特征在于,其包括以下步驟: S1:建立代表菌株基因組序列庫:對獲得的基因組序列庫中的序列按照設定閾值進行聚類,獲得不同株水平和或種水平的菌株簇;篩選獲得每個菌株簇的代表菌株序列以建立代表菌株基因組序列庫; S2:建立代謝產物基因簇序列庫:對獲得的基因組序列庫的序列進行基因注釋并預測每個菌株和或每個菌種的代謝產物基因簇,通過對代謝產物基因簇進行相似度聚類以獲得基因簇家族,將基因簇家族合并獲得代謝產物基因簇序列庫;步驟S1和步驟S2的操作順序可以互換或步驟S1和步驟S2可以同時進行; S3:獲取樣本的宏基因組測序數據,將宏基因組測序數據分別與步驟S1所述的代表菌株基因組序列庫、步驟S2所述的代謝產物基因簇序列庫進行比對,獲得每個菌株和或每個菌種的相對豐度以及代謝產物的相對豐度; S4:篩選顯著差異菌株和或菌種以及顯著差異代謝產物; S5:將菌株或菌種、及其代謝產物均具有顯著差異的候選菌株或候選菌種作為微生物標志物。
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