華南師范大學胡敏獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉華南師范大學申請的專利一種FRET敏化淬滅轉化因子測量數據的處理方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119541650B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-26發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202411453354.1,技術領域涉及:G16B40/00;該發明授權一種FRET敏化淬滅轉化因子測量數據的處理方法是由胡敏;杜蔓慧;陳同生;孫貝妮設計研發完成,并于2024-10-17向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種FRET敏化淬滅轉化因子測量數據的處理方法在說明書摘要公布了:本發明為一種FRET敏化淬滅轉化因子測量數據的處理方法,包括步驟:S1、制備FRET樣本并采集圖像;S2、利用頻率直方圖確定背景噪聲值并扣除;S3、獲取信號區域模板圖;S4、設置初始滑動窗口,篩選不重疊滑動窗口最多的有效數據區域后求平均值,將平均值代入mPb_G公式計算敏化淬滅轉化因子G的平均值和標準差;S5、改變滑動窗口,根據G值的平均值和標準差確定窗口大小;S6、將合適窗口大小下的G值數據繪制為偽彩圖和頻率直方圖,并輸出其平均值和標準差。本發明通過采用局部信號識別和均值計算的方法,過濾了細胞信號區域內部和邊緣的離散數據點,避免了光學系統噪聲以及多通道共定位不準確造成的計算誤差。
本發明授權一種FRET敏化淬滅轉化因子測量數據的處理方法在權利要求書中公布了:1.一種FRET敏化淬滅轉化因子測量數據的處理方法,其特征在于,包括以下步驟: S1、制備FRET樣本,采集光漂白前FRET通道AA、DA和DD圖像,然后采用短時間高強度激發的方式快速漂白樣本,最后采集光漂白后FRET通道AAP和DDP圖像;重復上述操作,獲取多組活細胞FRET樣本圖像以獲得統計結果; S2、生成若干張樣本圖像AA、DA、DD、AAP、DDP的灰度值頻率直方圖,以灰度值頻率直方圖的第一個非零峰值的灰度值為背景噪聲值,逐像素扣除若干張圖像的背景噪聲,若扣除背景噪聲后灰度值小于零,則將其置為零; S3、對光漂白前的AA、DA、DD圖像用適當的閾值進行二值化處理,處理后將這些二值化圖像相與,得到樣本圖像的二值化信號區域模板圖; S4、設置滑動窗口的大小為n*n,對二值化信號區域模板圖進行遍歷,采用動態規劃的思想在所有信號區域中選取不重疊的最多個數的有效數據窗口;利用二值化信號區域模板圖與原始圖像的信號區域位置的映射關系,根據選取到的有效數據窗口坐標確定原始圖像中有效數據窗口的坐標;對原始圖像中每一個窗口內的所有數據點灰度值進行平均,將平均值作為一個數據點代入mPb_G公式進行計算,并將計算結果G值保存在n*n窗口的有效數據列表中; S5、將滑動窗口增大為m*m,其中,m=n+1,重復步驟S4,計算m*m窗口和n*n窗口的有效數據列表中的平均值和標準差,若兩者的標準差之差小于各自的標準差,以及兩個窗口的變異系數均小于0.3時,數據趨于穩定,不需要再增大滑動窗口;否則,繼續增大窗口,重復步驟S4和步驟S5,直到滿足條件為止; S6、若數據趨于穩定,將光漂白程度x和敏化淬滅轉化因子G的有效數據轉化為偽彩圖和頻率直方圖,并輸出其平均值; 步驟S4中的有效數據是指在窗口內部所有數據點都是信號點,即所有數據點灰度值均為1,如果其中至少有一個數據點為0,則認為是無效區域;其具體公式為: 其中,Wi表示當前第i個窗口,Grayj表示第j個像素的灰度值,TRUE表示有效區域,FALSE表示無效區域;如果遍歷到無效區域,則不對其進行處理,尋找下一個有效區域; 步驟S4中采用動態規劃思想在所有信號區域中選取不重疊的最多個數的有效數據窗口,其具體公式為: dpxi,yi,xj,yj=max{dpxi,yi,xj,yj,dpxi,yi,xk,yk+dpxi,yk+1,xk,yj+dpxk+1,yi,xj,yk+dpxk+1,yk+1,xj,yj},i≤k≤j 其中,dpxi,yi,xj,yj表示從左上角xi,yi到右下角xj,yj區間內不重疊的最多個數的有效數據窗口;若當前位置xi,yi的n*n窗口Wi=TRUE,則下一次不重疊的有效數據窗口起點為xi+n,yi+n,否則,下一次不重疊的有效數據窗口起點為xi+1,yi+1。
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