上海百英生物科技股份有限公司楊宇星獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉上海百英生物科技股份有限公司申請的專利基于CDR移植的人源化抗體設計的裝置、方法和計算機可讀存儲介質獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119517172B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-26發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202411528599.6,技術領域涉及:G16B30/20;該發明授權基于CDR移植的人源化抗體設計的裝置、方法和計算機可讀存儲介質是由楊宇星;盧海松;王輝;徐延鎮;常留平設計研發完成,并于2024-10-30向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于CDR移植的人源化抗體設計的裝置、方法和計算機可讀存儲介質在說明書摘要公布了:本發明公開了基于CDR移植的人源化抗體設計的裝置、方法和計算機可讀存儲介質。本發明的方法通過將目標抗原異源抗體的抗原互補決定區序列替換人源化抗體序列的抗原互補決定區序列后得到CDR區域移植抗體;通過對CDR區域移植抗體和異源抗體的差異氨基酸位點進行單氨基酸回復突變后,比較突變前后蛋白三維結構的結構差異性分值;保留結構差異性分值小于等于1的單氨基酸回復突變位點,最終得到目標抗原的CDR移植的人源化抗體。本發明的方法可以增加異源抗體與人源抗體序列的相似度,減少目標抗原人源抗體的免疫原性并維持親和力。
本發明授權基于CDR移植的人源化抗體設計的裝置、方法和計算機可讀存儲介質在權利要求書中公布了:1.基于CDR區移植的人源化抗體獲得的裝置,其特征在于:所述裝置包括如下模塊: A1)人源化框架區的選取模塊:用于使用序列比對軟件獲得特異于目標抗原的異源抗體的人源化抗體序列; A2)CDR區域移植模塊:用于使用抗體序列CDR注釋系統對所述異源抗體的抗原互補決定區序列進行注釋得到異源抗體CDR序列,對所述人源化抗體序列進行注釋得到人源化抗體CDR序列;用所述異源抗體CDR序列替換所述人源化抗體序列中的所述人源化抗體CDR序列,得到目標抗原的CDR區域移植抗體序列; A3)回復突變位點的選擇和人源化抗體獲得模塊:用于將所述CDR區域移植抗體的序列與所述異源抗體的序列進行比對獲得差異氨基酸位點,分別將所述差異氨基酸位點中的每一個氨基酸位點單獨進行回復突變得到單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體,使用蛋白結構預測軟件對所有所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體進行結構預測得到所有所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體的三維結構,使用所述蛋白結構預測軟件預測所述異源抗體的三維結構得到異源抗體三維結構; 將所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體的三維結構和所述異源抗體三維結構使用如下式1進行結構差異性打分得到結構差異性分值; 式1; 式1中,score代表所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體的三維結構和所述異源抗體三維結構的結構差異性分值;important_score為對所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體的三維結構和所述異源抗體三維結構基于序列中每個氨基酸殘基的B-factor和親疏水性進行相似度打分得到的數值;exposed_area代表所述異源抗體的三維結構和所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體的三維結構暴露區域大小的差異值;3D_similarity為所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體的三維結構和所述異源抗體三維結構的結構相似性分值; 選擇所述結構差異性分值小于1的所述單氨基酸回復突變CDR區域移植抗體中的氨基酸突變位點進行合并得到回突組合位點,將所述CDR區域移植抗體序列中的所述回突組合位點位置的氨基酸殘基替換為所述異源抗體對應的所述回突組合位點位置的氨基酸殘基,得到目標抗原的人源化抗體序列。
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