深圳市硬核酸生物科技有限公司謝禹鑫獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉深圳市硬核酸生物科技有限公司申請的專利靶點選擇方法及裝置、計算機設備獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN116189756B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-26發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202211553944.2,技術領域涉及:G16B15/30;該發明授權靶點選擇方法及裝置、計算機設備是由謝禹鑫;陳盛培;陳婉婷;潘小瑜設計研發完成,并于2022-12-06向國家知識產權局提交的專利申請。
本靶點選擇方法及裝置、計算機設備在說明書摘要公布了:本公開提供了一種靶點選擇方法及裝置、計算機設備。方法包括:獲取mRNA靶點序列和NGS數據;基于所述mRNA靶點序列生成n1×N的序列特征矩陣;將所述序列矩陣和所述序列特征矩陣進行矩陣疊加,得到n1+1×N的一級結構矩陣;將所述一級結構矩陣降維處理成1×N的矩陣,并對所述1×N的矩陣進行對角化,得到N×N的二級結構矩陣;基于最優路徑搜索算法從所述二級結構矩陣中選取一個或多個最優路徑,并基于所述最優路徑確定所有候選靶標序列。該方案在選擇靶點時不僅考慮了NGS實驗的數據,還考慮了各個位點的特征,使得選出的位點結合率高。并且,該方法無需對每個位點進行生物實驗,耗時短,成本低,效果好。
本發明授權靶點選擇方法及裝置、計算機設備在權利要求書中公布了:1.一種靶點選擇方法,其特征在于,所述方法包括: 獲取信使核糖核酸mRNA靶點序列和新一代測序NGS數據,所述mRNA靶點序列的長度為N,所述NGS數據為1×N的序列矩陣,所述序列矩陣的每個元素對應mRNA靶點序列的一個位點,所述序列矩陣的每個元素表示對應的位點在NGS實驗中被N20片段雜合的次數; 基于所述mRNA靶點序列生成n1×N的序列特征矩陣,所述序列特征矩陣的每一列元素對應mRNA靶點序列的一個位點,所述序列特征矩陣的每一列元素表示對應的位點的n1個特征; 將所述序列矩陣和所述序列特征矩陣進行矩陣疊加,得到(n1+1)×N的一級結構矩陣; 將所述一級結構矩陣的每一列元素相加,得到1×N的矩陣; 按照公式Pij=Pi×Pj的方式計算N×N的二級結構矩陣中的各個元素,將計算結果填入所述二級結構矩陣中,所述二級結構矩陣的每個元素表示對應二級結構的打開概率;其中,Pij為所述二級結構矩陣中的第i行第j個元素,Pi為所述1×N的矩陣中的第i個元素,Pj為所述1×N的矩陣中的第j個元素,所述i、j均為[1,N]中的正整數; 基于n2個選擇條件,得到n2個N×N的選擇條件矩陣,所述選擇條件矩陣的每個元素表示對應二級結構在對應條件下的分值,N、n1、n2均為正整數; 將所述n2個N×N的選擇條件矩陣降維處理成N×N的矩陣,并與所述N×N的二級結構矩陣相加,得到N×N的路徑打分矩陣; 基于最優路徑搜索算法從所述路徑打分矩陣中選取一個或多個最優路徑,并基于所述最優路徑確定所有候選靶標序列。
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