中國科學院深圳先進技術研究院楊統見獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中國科學院深圳先進技術研究院申請的專利一種CRISPR質粒與引物設計系統獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN117316287B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-26發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202311060144.1,技術領域涉及:G16B35/10;該發明授權一種CRISPR質粒與引物設計系統是由楊統見;謝尚波;凌路頔;肖貢;羅小舟;杰·基斯林設計研發完成,并于2023-08-22向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種CRISPR質粒與引物設計系統在說明書摘要公布了:本發明公開了一種CRISPR質粒與引物設計系統,屬于生物信息學技術領域。本發明公開了一種可以允許客戶給定基因組、給定CRISPR母版載體、允許對多個靶點進行批量的引物和質粒圖譜設計,輸出的結果除gRNA及質量評估以外,還提供了可用于擴增gRNA、同源臂、載體骨架的引物、鑒定引物以及方便后續克隆構建時的測序數據比對以及追溯的質粒圖譜。本發明通過Border引物設計策略克服了常規引物設計帶來的3’端引物特異性差的問題。設計完整引物的同時滿足擴增獲得完整的目標DNA序列及3'端特異性更高的要求。
本發明授權一種CRISPR質粒與引物設計系統在權利要求書中公布了:1.一種CRISPR質粒與引物設計的方法,其特征在于,所述方法包括: (1)獲取構建CRISPR質粒所需的信息,包括目標基因組、編輯靶點、線性化載體骨架、基因編輯類型、gRNA_common_part、gRNA設計參數、引物設計參數: (2)對目標基因組的靶點基因進行gRNA序列的設計和篩選; (3)用于設計和評估構建CRISPR質粒所需的引物; (4)繪制完整的注釋有gRNA、gRNA_common_part、敲入片段、同源臂、引物信息的質粒圖譜; 所述引物的設計采用或不采用Border_Range引物設計策略,所述Border_Range引物設計策略: 正向引物:在目標片段的5’端一側較寬的范圍內設計用于擴增目標片段的引物,獲得有效引物Efficientprimer,再與Efficientprimer的5’端延伸至目標片段的5’端的邊界序列Primer_Border連接,獲得完整的正向引物; 反向引物:在目標片段的3’端一側較寬的范圍內設計用于擴增目標片段的引物,獲得有效引物Efficientprimer,再與Efficientprimer的5’端延伸至目標片段的3’端的Primer_Border連接,獲得完整的反向引物; 所述較寬的范圍是距離片段5’端或3’端>0bp的區域。
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