北京大學成都前沿交叉生物技術研究院;北京大學伊成器獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉北京大學成都前沿交叉生物技術研究院;北京大學申請的專利一種甲基化特征編碼模型的處理方法和裝置獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN120299532B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-12發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202510354822.8,技術領域涉及:G16B40/20;該發明授權一種甲基化特征編碼模型的處理方法和裝置是由伊成器;溫翰;賀博;李明陽;顧睿初設計研發完成,并于2025-03-25向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種甲基化特征編碼模型的處理方法和裝置在說明書摘要公布了:本發明實施例涉及一種甲基化特征編碼模型的處理方法和裝置,所述方法包括:采集BS?seq讀段集合;根據讀段集合進行讀段拼接得到第一序列、對第一序列進行五元素序列轉換得到第二序列、基于第二序列進行詞匯表學習;構建甲基化特征編碼模型、序列解碼模型、目標來源預測模型;由甲基化特征編碼模型和序列解碼模型組成預訓練模型框架、由甲基化特征編碼模型和目標來源預測模型組成第一任務模型框架;對預訓練模型框架、第一任務模型框架進行訓練;訓練結束后基于預訓練模型框架處理甲基化序列重構任務、基于第一任務模型框架處理DNA來源識別任務。通過本發明可以提高任務處理實時性、降低任務處理成本。
本發明授權一種甲基化特征編碼模型的處理方法和裝置在權利要求書中公布了:1.一種甲基化特征編碼模型的處理方法,其特征在于,所述方法包括: 為DNA序列中的5-甲基胞嘧啶設置一個對應的拓展標記符記為堿基標記符M,并將DNA的四元堿基集合[A,T,C,G]調整為對應的五元堿基集合[A,T,C,G,M];并對第一物種的亞硫酸氫鹽測序讀段進行大數據采集組成對應的BS-seq讀段集合;并根據所述BS-seq讀段集合進行讀段拼接得到對應的第一堿基序列;并基于所述五元堿基集合[A,T,C,G,M]和所述第一堿基序列上各堿基標記符C對應的甲基化狀態標記對所述第一堿基序列進行五元素序列轉換得到對應的第二堿基序列;并基于BPE算法和所述第二堿基序列進行詞匯表學習得到對應的第一詞匯表; 以MosaicBERT模型為核心構建甲基化特征編碼模型;并將所述第一詞匯表存入所述甲基化特征編碼模型的詞表存儲模塊;并構建一個用于甲基化序列重構的序列解碼模型;并基于一類目標來源類型構建一個對應的二分類預測模型記為目標來源預測模型;所述目標來源類型具體為一類組織類型或一類細胞類型; 由所述甲基化特征編碼模型和所述序列解碼模型組成預訓練模型框架;并根據所述第二堿基序列對所述預訓練模型框架進行第一框架訓練得到對應的編碼模型預訓練參數; 由所述甲基化特征編碼模型和所述目標來源預測模型組成第一任務模型框架;并基于所述BS-seq讀段集合和所述目標來源類型構建模型數據集;并基于所述編碼模型預訓練參數和所述模型數據集對所述第一任務模型框架進行第二框架訓練; 第一、第二框架訓練結束后,基于所述預訓練模型框架處理DNA序列的甲基化序列重構任務;并基于所述第一任務模型框架處理一類與所述目標來源類型對應的DNA序列來源識別任務。
如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人北京大學成都前沿交叉生物技術研究院;北京大學,其通訊地址為:610095 四川省成都市高新區桂溪街道天府五街200號菁蓉匯7號樓A區2樓203室;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。
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