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          常州大學(xué)侯振杰獲國家專利權(quán)

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          龍圖騰網(wǎng)獲悉常州大學(xué)申請的專利一種基于元路徑整合多源生物數(shù)據(jù)的藥物重定位方法獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN119833064B

          龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-09-26發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202411877478.2,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16H20/10;該發(fā)明授權(quán)一種基于元路徑整合多源生物數(shù)據(jù)的藥物重定位方法是由侯振杰;孫曉燕;林恩;文霖川;胡嘉昊設(shè)計研發(fā)完成,并于2024-12-19向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。

          一種基于元路徑整合多源生物數(shù)據(jù)的藥物重定位方法在說明書摘要公布了:本發(fā)明涉及藥物技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種基于元路徑整合多源生物數(shù)據(jù)的藥物重定位方法,包括獲取原始數(shù)據(jù)集;構(gòu)建融合異構(gòu)網(wǎng)絡(luò),將藥物、疾病、蛋白質(zhì)兩兩組合的關(guān)聯(lián)矩陣以及各自的相似性矩陣融合得到異構(gòu)圖;基于元路徑和相似性的負(fù)采樣設(shè)計多級關(guān)聯(lián)路徑,基于相似性原理融合異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)中同級網(wǎng)絡(luò)的相似性信息,選取負(fù)鏈接樣本;提取藥物特征;構(gòu)建SMS?MPF模塊,通過異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)對元路徑進行游走,提取并融合不同元路徑間的特征,獲得藥物和疾病的關(guān)聯(lián)特征;將疾病表型相似性矩陣、藥物特征和藥物和疾病的關(guān)聯(lián)特征輸入關(guān)聯(lián)預(yù)測模塊中得到最終的節(jié)點表示。本發(fā)明解決現(xiàn)有方法在正負(fù)樣本的選取上存在顯著缺陷問題。

          本發(fā)明授權(quán)一種基于元路徑整合多源生物數(shù)據(jù)的藥物重定位方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種基于元路徑整合多源生物數(shù)據(jù)的藥物重定位方法,其特征在于,包括以下步驟: 步驟一、獲取包括藥物、疾病、蛋白質(zhì)相似性矩陣;藥物-蛋白、藥物-疾病、疾病-蛋白鄰接矩陣;疾病綜合相似度矩陣、藥物綜合相似度矩陣的原始數(shù)據(jù)集; 步驟二、利用融合異構(gòu)網(wǎng)絡(luò),將藥物、疾病、蛋白質(zhì)兩兩組合的關(guān)聯(lián)矩陣以及各自的相似性矩陣進行融合,得到藥物-蛋白質(zhì)-疾病異構(gòu)圖; 步驟三、基于元路徑和相似性的負(fù)采樣設(shè)計多級關(guān)聯(lián)路徑,基于相似性原理融合異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)中同級網(wǎng)絡(luò)的相似性信息,選取負(fù)鏈接樣本; 步驟三具體包括: 根據(jù)不同元路徑的種類長度,對藥物-疾病鄰接矩陣A dr-d 賦予不同的權(quán)重,得到賦權(quán)重后的藥物-疾病鄰接矩陣A ’ dr-d ; 對于藥物和疾病,基于關(guān)聯(lián)矩陣以及各自的相似性矩陣來衡量二者間的距離,公式為: 其中,,,表示與藥物相關(guān)聯(lián)的疾病集合,表示與疾病相關(guān)聯(lián)的藥物集合; 步驟四、構(gòu)建基于SMILE序列的藥物特征提取模塊,將GCN用于藥物SMILE序列形成的分子結(jié)構(gòu)圖上,提取藥物特征; 藥物特征的公式為: 其中,為自循環(huán)的無向圖,為藥物特征; 步驟五、構(gòu)建SMS-MPF模塊,通過異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)對元路徑進行游走,提取并融合不同元路徑間的特征,獲得藥物和疾病的關(guān)聯(lián)特征; 藥物和疾病的關(guān)聯(lián)特征的公式為: 其中,MPF為元路徑融合運算,是節(jié)點的特征,是與節(jié)點相關(guān)的各類元路徑集合,表示基于元路徑的共享最大子圖; 步驟六、將疾病表型相似性矩陣、藥物特征和藥物和疾病的關(guān)聯(lián)特征輸入關(guān)聯(lián)預(yù)測模塊中得到最終的節(jié)點表示; 最終的節(jié)點表示公式為: 其中,、分別為藥物和疾病的關(guān)聯(lián)特征,為最終的藥物特征,S d 為疾病表型相似性矩陣; 關(guān)聯(lián)預(yù)測模塊采用sigmoid函數(shù)的損失函數(shù),公式為: 其中,是可學(xué)習(xí)的對角矩陣參數(shù),是sigmoid函數(shù),表示正鏈接集合,即觀察圖;是采樣的負(fù)鏈接所服從的分布。

          如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人常州大學(xué),其通訊地址為:213164 江蘇省常州市武進區(qū)滆湖中路21號;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。

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