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龍圖騰網(wǎng)獲悉中國(guó)科學(xué)院微生物研究所申請(qǐng)的專(zhuān)利一種病毒物種鑒定方法、鑒定系統(tǒng)、設(shè)備和介質(zhì)獲國(guó)家發(fā)明授權(quán)專(zhuān)利權(quán)，本發(fā)明授權(quán)專(zhuān)利權(quán)由國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予，授權(quán)公告號(hào)為：CN119920328B 。

龍圖騰網(wǎng)通過(guò)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-09-26發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉：該發(fā)明授權(quán)的專(zhuān)利申請(qǐng)?zhí)?專(zhuān)利號(hào)為：202510386517.7，技術(shù)領(lǐng)域涉及：G16B50/00；該發(fā)明授權(quán)一種病毒物種鑒定方法、鑒定系統(tǒng)、設(shè)備和介質(zhì)是由吳林寰;張倩;陳奇;郭翀曄;孫清嵐;蘭宇;范國(guó)梅;馬俊才;解建雪設(shè)計(jì)研發(fā)完成，并于2025-03-31向國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專(zhuān)利申請(qǐng)。

本一種病毒物種鑒定方法、鑒定系統(tǒng)、設(shè)備和介質(zhì)在說(shuō)明書(shū)摘要公布了：本發(fā)明公開(kāi)了一種病毒物種鑒定方法、鑒定系統(tǒng)、設(shè)備和介質(zhì)，所述方法包括：獲取包括非冗余的病毒種和亞種序列的原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)；將原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中序列打斷，并和原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，替換原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)上超過(guò)1處的序列得到第一參考數(shù)據(jù)庫(kù)；將二代三代測(cè)序的原始下機(jī)數(shù)據(jù)比對(duì)到第一參考數(shù)據(jù)庫(kù)，基于比對(duì)豐度鑒定物種；將原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)的序列打斷，和原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，將比對(duì)上的序列替換得到第二參考數(shù)據(jù)庫(kù)；將拼接后的基因組數(shù)據(jù)比對(duì)到第二參考數(shù)據(jù)庫(kù)，基于位分?jǐn)?shù)鑒定物種。本發(fā)明設(shè)計(jì)直接使用reads數(shù)據(jù)比對(duì)策略，并用于病毒物種鑒定的標(biāo)準(zhǔn)化分析流程，本發(fā)明能夠鑒定的物種多，可精確到亞種水平，鑒定率高且快速。

本發(fā)明授權(quán)一種病毒物種鑒定方法、鑒定系統(tǒng)、設(shè)備和介質(zhì)在權(quán)利要求書(shū)中公布了：1.一種病毒物種鑒定方法，其特征在于，包括： 獲取原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)，所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)包括非冗余的病毒種的基因組序列和非冗余的病毒亞種的具有代表性的功能性片段序列； 將所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中所有序列打斷得到若干第一片段，對(duì)每個(gè)第一片段均使用BWT算法和原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，第一片段比對(duì)上的序列超過(guò)1處時(shí)，將原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)上的序列段的堿基全部替換為N，得到第一參考數(shù)據(jù)庫(kù)； 利用BWT算法將二代或三代測(cè)序的原始下機(jī)數(shù)據(jù)比對(duì)到第一參考數(shù)據(jù)庫(kù)，獲得唯一比對(duì)上的reads，對(duì)所述唯一比對(duì)上的reads進(jìn)行物種豐度統(tǒng)計(jì)，最高比對(duì)豐度的物種作為鑒定得到的物種； 以第三長(zhǎng)度的步長(zhǎng)滑動(dòng)，將所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中的所有基因組序列打斷得到若干第二片段，對(duì)每個(gè)第二片段均使用BLAST算法和原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，如果第二片段和原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因組序列比對(duì)相似性達(dá)到第一閾值，且比對(duì)上的子片段長(zhǎng)度不低于第三長(zhǎng)度的位置超過(guò)1處，則將原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)上的序列段的堿基全部替換為N，得到第二參考數(shù)據(jù)庫(kù)； 使用BLAST算法將拼接后的基因組數(shù)據(jù)比對(duì)到第二參考數(shù)據(jù)庫(kù)，bit-score值最高的基因組序列所屬物種作為鑒定得到的物種； 所述鑒定方法還包括： 獲得待鑒定病毒物種的基因數(shù)據(jù)； 確定待鑒定病毒物種的基因數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)類(lèi)型，所述數(shù)據(jù)類(lèi)型包括拼接后的基因組數(shù)據(jù)、二代測(cè)序的原始下機(jī)數(shù)據(jù)、三代測(cè)序的原始下機(jī)數(shù)據(jù)； 所述將所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中的所有序列打斷得到若干第一片段具體為：以第一長(zhǎng)度的步長(zhǎng)滑動(dòng)，將所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中的所有基因組序列按照第二長(zhǎng)度打斷得到若干第一片段； 所述將所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中的所有基因組序列打斷具體為：將所述原始參考數(shù)據(jù)庫(kù)中的所有序列按照第四長(zhǎng)度打斷得到若干第二片段； 所述第一長(zhǎng)度為10bp，第二長(zhǎng)度為50bp，第三長(zhǎng)度為50bp，第四長(zhǎng)度為500bp，第一閾值取值的范圍為[98%，100%]。

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