中國科學(xué)院海洋研究所張國范獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉中國科學(xué)院海洋研究所申請的專利一種篩選高糖原含量長牡蠣親貝的方法及其相關(guān)的SNP引物對獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN107475415B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-09-09發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:201710855508.3,技術(shù)領(lǐng)域涉及:C12Q1/6858;該發(fā)明授權(quán)一種篩選高糖原含量長牡蠣親貝的方法及其相關(guān)的SNP引物對是由張國范;李莉;孟杰;宋凱;李春燕;劉圣;史瑞輝;劉優(yōu)麗設(shè)計研發(fā)完成,并于2017-09-20向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本一種篩選高糖原含量長牡蠣親貝的方法及其相關(guān)的SNP引物對在說明書摘要公布了:本發(fā)明涉及一種篩選高糖原含量長牡蠣親貝的方法及其相關(guān)的SNP引物對。通過486個個體的全基因組關(guān)聯(lián)分析,鑒定出位于長牡蠣6號染色體上的67個與糖原含量顯著相關(guān)的SNP信號。針對該區(qū)域scaffold1243_53489堿基處的1個SNP位點,開發(fā)了其相應(yīng)的檢測方法,結(jié)果表明利用該方法可以簡單迅速檢測該SNP位點。同時該位點CC基因型個體相比較于TT基因型個體。篩選CC基因型的親貝,指導(dǎo)牡蠣育種。所述長牡蠣該位點上下游500kb的核苷酸序列如SEQIDNo.1所示。本發(fā)明有益效果在于苗種繁育前對親貝進行基因型鑒定,提高子代糖原含量。本研究結(jié)果獲得SNP標記可信度更高,效果更穩(wěn)定。
本發(fā)明授權(quán)一種篩選高糖原含量長牡蠣親貝的方法及其相關(guān)的SNP引物對在權(quán)利要求書中公布了:1.一種判斷長牡蠣SNP標記基因型的方法,其特征在于: SNP引物對: 正向引物為F:5’-TAGTATTAAGGCACATGCCG-3’; 反向引物為R:5’-ATGATGTTTACTTGTTTGCTTG-3’。 通過全基因組關(guān)聯(lián)分析獲得一個SNP標記,其位于長牡蠣基因組scaffold1243_53,489kb堿基處;該位點存在T和C兩個堿基形式,在苗種繁育前對親貝進行該SNP標記位點基因型鑒定,不同基因型糖原含量的順序為CCTCTT,通過篩選該位點CC基因型的親貝,提高后代群體的糖原含量, 包括步驟如下: 1所述長牡蠣基因組的提取,具體為提取長牡蠣基因組DNA,使用滅菌水或TE緩沖液稀釋到10-20nguL; 2所述長牡蠣基因組DNA為模板,配制反應(yīng)體系:基因組DNA1uL,通用PCRmix5uL,引物F和R各0.2uL,滅菌雙蒸水3.6uL;所述反應(yīng)體系可同比放大; 3PCR擴增的反應(yīng)程序為: 35-55個循環(huán)可根據(jù)需要選擇循環(huán)數(shù) 4所述的PCR反應(yīng)結(jié)束后,加入飽和熒光染料Lcgreen及內(nèi)標各1uL,經(jīng)過95℃-98℃退火5-10min; 5退火后自然降溫至室溫,進行高分辨率熔解曲線分析,鑒定待測樣 a利用內(nèi)標的熔解曲線對所有待測樣本的熔解曲線進行校正; b對校正后的所有待測樣本熔解曲線進行分群,當(dāng)熔解曲線求導(dǎo)后為單峰且峰值對應(yīng)橫坐標溫度大于77.5℃時SNP基因型為CC,當(dāng)熔解曲線求導(dǎo)后為單峰且峰值對應(yīng)橫坐標溫度小于77.5℃時SNP基因型為TT,當(dāng)熔解曲線求導(dǎo)后為雙峰時SNP基因型為TC。 c判斷每個待測樣本所述長牡蠣SNP標記基因型。 所述步驟5中,內(nèi)標為等量混合的高溫內(nèi)標和低溫內(nèi)標,即兩條具有不同GC含量的雙鏈寡核苷酸,高、低溫內(nèi)標終濃度分別為2.5μM; SNP基因型鑒定時所需的高、低內(nèi)標序列,其中, 高溫內(nèi)標序列為: 低溫內(nèi)標序列為:
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人中國科學(xué)院海洋研究所,其通訊地址為:266071 山東省青島市市南區(qū)南海路7號;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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