西安電子科技大學(xué)黃曉太獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉西安電子科技大學(xué)申請的專利基于單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和時(shí)序的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng)及方法獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN116741279B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-09-05發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202310564195.1,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B40/00;該發(fā)明授權(quán)基于單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和時(shí)序的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng)及方法是由黃曉太;張曉紀(jì)設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2023-05-18向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本基于單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和時(shí)序的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng)及方法在說明書摘要公布了:本發(fā)明公開了一種基于單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和時(shí)序的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng)及方法,本發(fā)明從單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)基因表達(dá)矩陣中提取每個(gè)目標(biāo)基因的拓?fù)浼s束,在每個(gè)目標(biāo)基因拓?fù)浼s束的基礎(chǔ)下,結(jié)合單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)基因表達(dá)數(shù)據(jù)和單細(xì)胞時(shí)序基因表達(dá)數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控關(guān)系,得到基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。由于本發(fā)明中的拓?fù)浼s束提取模塊提取每個(gè)目標(biāo)基因的拓?fù)浼s束,在拓?fù)浼s束下進(jìn)行后續(xù)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷,提高了基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷的準(zhǔn)確性,降低了系統(tǒng)的運(yùn)行成本。本發(fā)明使用Borda投票法結(jié)合從單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)基因表達(dá)數(shù)據(jù)和單細(xì)胞時(shí)序基因表達(dá)數(shù)據(jù)得到的調(diào)控關(guān)系,進(jìn)一步提升了基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng)的準(zhǔn)確性。
本發(fā)明授權(quán)基于單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和時(shí)序的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng)及方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種基于單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和時(shí)序的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷系統(tǒng),包括拓?fù)浼s束提取模塊、調(diào)控關(guān)系結(jié)合模塊、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)生成模塊,其特征在于,還包括穩(wěn)態(tài)調(diào)控關(guān)系推斷模塊,時(shí)序調(diào)控關(guān)系推斷模塊;其中: 所述拓?fù)浼s束提取模塊,使用WGCNA聚類方法,從單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)基因表達(dá)矩陣中提取每個(gè)目標(biāo)基因的拓?fù)浼s束; 所述穩(wěn)態(tài)調(diào)控關(guān)系推斷模塊,在每個(gè)目標(biāo)基因的拓?fù)浼s束下,生成該目標(biāo)基因與其它基因之間的調(diào)控關(guān)系向量,將所有目標(biāo)基因的調(diào)控關(guān)系向量組成單細(xì)胞穩(wěn)態(tài)基因表達(dá)數(shù)據(jù)的調(diào)控關(guān)系矩陣A; 所述時(shí)序調(diào)控關(guān)系推斷模塊,在每個(gè)目標(biāo)基因的拓?fù)浼s束下,生成該目標(biāo)基因與其它基因之間的調(diào)控關(guān)系向量;將所有目標(biāo)基因的調(diào)控關(guān)系向量組成單細(xì)胞時(shí)序基因表達(dá)數(shù)據(jù)的調(diào)控關(guān)系矩陣B; 所述調(diào)控關(guān)系結(jié)合模塊,使用Borda投票法,分別對調(diào)控關(guān)系矩陣A和B打分,得到所有基因之間存在調(diào)控關(guān)系的可能性排名; 所述基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)生成模塊,通過參數(shù)因子生成基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人西安電子科技大學(xué),其通訊地址為:710071 陜西省西安市雁塔區(qū)太白南路2號;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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