河南大學金勇獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉河南大學申請的專利基于編碼器的梯度提升機miRNA-疾病關聯預測方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN117198407B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-22發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202311235759.3,技術領域涉及:G16B40/20;該發明授權基于編碼器的梯度提升機miRNA-疾病關聯預測方法是由金勇;侯懷彬設計研發完成,并于2023-09-22向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于編碼器的梯度提升機miRNA-疾病關聯預測方法在說明書摘要公布了:本發明涉及生物信息學關聯預測技術領域,具體涉及基于編碼器的梯度提升機miRNA?疾病關聯預測方法,該方法包括:利用多源生物學和醫學信息獲取miRNA?疾病關聯鄰接矩陣,miRNA功能相似性矩陣,疾病語義相似性矩陣;整合得到的miRNA和疾病的整合相似性矩陣與miRNA?疾病關聯鄰接矩陣進行拼接得到信息量更豐富的miRNA?疾病關聯特征向量;利用自動編碼器提取綜合miRNA特征向量和疾病特征向量的關鍵特征,利用輕量梯度提升機分類器實現miRNA與疾病的潛在關聯預測。本發明實現的預測精度高,時間和經濟成本低,目的是挖掘潛在miRNA和疾病關聯,可以為研究復雜疾病的發病機理提供幫助。
本發明授權基于編碼器的梯度提升機miRNA-疾病關聯預測方法在權利要求書中公布了:1.一種基于編碼器的梯度提升機miRNA-疾病關聯預測方法,其特征在于,包括以下步驟: 步驟1,從預設數量個外部生物和醫學數據源獲取miRNA-疾病關聯數據,疾病的自相關數據和miRNA的自相關數據; 步驟2,根據步驟1獲取的數據,計算得到疾病語義相似性矩陣; 步驟3,根據步驟1獲取的數據,計算得到miRNA的功能相似性矩陣; 步驟4,根據步驟1獲取的miRNA-疾病關聯數據,得到miRNA-疾病關聯鄰接矩陣,并根據miRNA-疾病關聯鄰接矩陣,分別計算得到miRNA和疾病的高斯相互作用譜核相似性矩陣; 步驟5,根據步驟2獲得的疾病語義相似性矩陣和步驟3獲得的miRNA的功能相似性矩陣分別與步驟4計算得到的miRNA和疾病的高斯相互作用譜核相似性矩陣進行整合,得到miRNA和疾病的整合相似性矩陣; 步驟6,根據步驟5得到的miRNA和疾病的整合相似性矩陣分別與miRNA-疾病關聯鄰接矩陣進行拼接,得到miRNA和疾病綜合相似性矩陣; 步驟7,將步驟6獲得的miRNA和疾病綜合相似性矩陣的特征向量輸入到自動編碼器進行特征提取,提取到低維高質量的miRNA-疾病關聯特征向量; 步驟8,將步驟7得到的低維高質量的miRNA-疾病關聯特征向量輸入輕量梯度提升機分類器進行miRNA-疾病關聯預測; 得到的miRNA和疾病綜合相似性矩陣分別為: 其中,,,,分別表示第個miRNA與其它miRNA的整合相似性,第個疾病和其它疾病的整合相似性,已驗證的miRNA-疾病關聯矩陣的第行,已驗證的miRNA-疾病關聯矩陣的第列轉置; 所述將步驟6獲得的miRNA和疾病綜合相似性矩陣的特征向量輸入到自動編碼器進行特征提取,提取到低維高質量的miRNA-疾病關聯特征向量,包括: 分別利用自編碼器對495×383行495+495列的矩陣和495×383行383+383列的矩陣進行處理,提取它們的低維特征,同時降低原始特征向量中隱藏的冗余信息帶來的噪聲,得到兩個低維高質量的miRNA-疾病關聯特征向量。
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