塔塔咨詢服務(wù)有限公司思沃迪哈·安納德獲國(guó)家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉塔塔咨詢服務(wù)有限公司申請(qǐng)的專利用于污染物的生物修復(fù)的系統(tǒng)和方法獲國(guó)家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN114341987B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-09-26發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202080041904.2,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B20/00;該發(fā)明授權(quán)用于污染物的生物修復(fù)的系統(tǒng)和方法是由思沃迪哈·安納德;米塔利·麥錢特;安維薩·莫哈帕特拉;沙爾米拉·謝卡爾·曼德;維尼特·巴特;普雷蒂·阿拉格萊·珊伯特設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2020-04-11向國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本用于污染物的生物修復(fù)的系統(tǒng)和方法在說明書摘要公布了:多種污染物對(duì)環(huán)境的污染正在成為一個(gè)全球性的健康問題。許多方法被用于這些污染物的生物修復(fù)。已經(jīng)提供了用于一種或多種污染物的方法和系統(tǒng)。樣本是從含有污染物的場(chǎng)地采集的。隨后從樣本中分離污染物。此外還創(chuàng)建了這些污染物的各種類型的降解劑的知識(shí)庫。使用該知識(shí)庫創(chuàng)建微生物圖譜。隨后利用微生物圖譜設(shè)計(jì)第一微生物群落和第二微生物群落,它們共同提供了降解污染物所需的基因、蛋白質(zhì)和酶。最后,第一微生物群落和或第二微生物群落的混合物施用于該場(chǎng)地。該方法進(jìn)一步包括檢查所施用的混合物的功效并且進(jìn)一步包括該混合物的重新施用。
本發(fā)明授權(quán)用于污染物的生物修復(fù)的系統(tǒng)和方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種用于一種或多種污染物的生物修復(fù)的方法200,所述方法包括: 從含有所述一種或多種污染物的環(huán)境場(chǎng)地采集樣本202; 分離和識(shí)別所述樣本中存在的所述一種或多種污染物204; 創(chuàng)建知識(shí)庫,其中,所述知識(shí)庫存儲(chǔ): 已識(shí)別的所述一種或多種污染物的信息, 關(guān)于在微生物中識(shí)別的能夠完全降解所述一種或多種污染物或部分降解所述一種或多種污染物的完全降解途徑和部分降解途徑的信息, 關(guān)于所述微生物繁衍的各自環(huán)境生態(tài)位的信息,和 來自不同環(huán)境的具有特定的完全部分污染物降解途徑的微生物的列表, 其中,所述特定的完全降解途徑是指一組微生物基因組上的基因和或由所述微生物編碼的蛋白質(zhì),其中,該組基因和或編碼的蛋白質(zhì)負(fù)責(zé)將污染物完全降解為對(duì)于所述環(huán)境場(chǎng)地安全的化合物或能夠由所述環(huán)境中存在的一種或多種其他微生物同化的化合物, 其中,所述微生物中的所述部分降解途徑是指構(gòu)成一個(gè)或多個(gè)子途徑的一組基因或編碼的蛋白質(zhì),其中,子途徑是在所述微生物的基因組內(nèi)編碼的所述完全降解途徑的子集,并且所述子途徑將所述污染物降解為中間體化合物,所述中間體化合物能夠由所述微生物釋放到所述環(huán)境中,隨后由所述環(huán)境中的另一種微生物吸收,其中,所述另一種微生物具有代謝所釋放的所述中間體化合物的另一個(gè)子途徑,其中,所述知識(shí)庫包括針對(duì)采集的所述樣本中識(shí)別的所述一種或多種污染物中的每一種的污染物途徑有機(jī)體矩陣PPOM、基因組途徑酶GPE圖譜、基因組途徑主圖譜GPM和豐富環(huán)境微生物數(shù)據(jù)庫DEBG,其中,所述GPE圖譜包括所述DEBG中列出的微生物名稱以及關(guān)于每個(gè)微生物基因組上多個(gè)子途徑中涉及的每種酶的活性位點(diǎn)的信息206, 其中,創(chuàng)建所述知識(shí)庫的步驟進(jìn)一步包括: 使用文獻(xiàn)挖掘技術(shù)識(shí)別微生物中的一個(gè)或多個(gè)降解途徑和相應(yīng)的基因蛋白質(zhì),其中,所述一個(gè)或多個(gè)途徑降解分離和識(shí)別的所述一種或多種污染物,其中,所述文獻(xiàn)挖掘還進(jìn)行了識(shí)別一組微生物,在所述一組微生物中,所述一個(gè)或多個(gè)降解途徑得到表征,其中,所述文獻(xiàn)挖掘進(jìn)行了獲得關(guān)于所述微生物存在和分離的所述環(huán)境生態(tài)位的信息; 識(shí)別完全或部分降解分離的所述一種或多種污染物的所述降解途徑中的多個(gè)子途徑,其中,與所述多個(gè)子途徑中的每一個(gè)對(duì)應(yīng)的基因和或蛋白質(zhì)或酶是由單種微生物的基因組或多種微生物的基因組編碼的,由所述多個(gè)子途徑中的每一個(gè)形成的產(chǎn)物被釋放到所述環(huán)境場(chǎng)地中,其中,所述產(chǎn)物被所述單個(gè)微生物代謝或者由存在于所述環(huán)境中的其他一種或多種微生物吸收,其中,所述其他多種微生物具有代謝所述產(chǎn)物的能力; 使用關(guān)于針對(duì)一個(gè)或多個(gè)識(shí)別的污染物中每一個(gè)的識(shí)別的降解途徑、所述降解途徑的所述多個(gè)子途徑、表征所述降解途徑的所述一組微生物的信息以及基于關(guān)于從中分離出所述一組微生物的一個(gè)或多個(gè)相應(yīng)的所述環(huán)境生態(tài)位的文獻(xiàn)挖掘和人工管理的信息來創(chuàng)建污染物途徑有機(jī)體矩陣PPOM; 使用所述文獻(xiàn)挖掘技術(shù)創(chuàng)建豐富環(huán)境微生物數(shù)據(jù)庫DEBG,其中,所述DEBG包含關(guān)于微生物和所述微生物繁衍的不同的環(huán)境生態(tài)位的信息; 從預(yù)先創(chuàng)建的蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫pfamDB創(chuàng)建途徑結(jié)構(gòu)域圖譜PDM,其中,所述PDM中包含的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域?qū)?yīng)于構(gòu)成所述多個(gè)子途徑的基因蛋白質(zhì),所述多個(gè)子途徑包含針對(duì)所述一種或多種污染物創(chuàng)建的所述PPOM中存在的每個(gè)降解途徑; 創(chuàng)建基因組圖譜GM,其中,所述基因組圖譜包括關(guān)于所有微生物基因組的信息,其中,所述信息還包括微生物中根據(jù)各自基因組位置排序的基因列表以及這些基因中編碼的組成蛋白結(jié)構(gòu)域; 在存儲(chǔ)在所述DEBG中的微生物基因組上搜索PPOM中列出的所有途徑的所述多個(gè)子途徑中每一個(gè)的PDM中包含的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的存在,以確定所述基因組上存在這些子途徑,其中,使用所述基因組圖譜GM作為數(shù)據(jù)庫進(jìn)行所述搜索,其中,如果所述PDM中列出的提供所述PDM的子途徑的基因組中的結(jié)構(gòu)域在所述基因組上基因的窗口尺寸內(nèi)出現(xiàn)并且數(shù)量超過預(yù)定義的閾值,則來自所述PDM的所述子途徑被認(rèn)為是存在的; 針對(duì)采集的所述樣本中識(shí)別的所述一種或多種污染物中的每一種,使用與DEBG中的所述微生物基因組對(duì)應(yīng)的微生物名稱以及關(guān)于所述基因組上所述多個(gè)途徑和所述多個(gè)子途徑的存在或不存在的信息創(chuàng)建基因組途徑主圖譜GPM,其中,基于第一預(yù)定義標(biāo)準(zhǔn),所述GPM圖譜具有0或1的數(shù)值,其中,所述GPM提供關(guān)于所述GPM中列出的所述微生物基因組中的每一個(gè)基因組中存在的給定污染物降解途徑的所有子途徑的信息;以及 針對(duì)采集的所述樣本中識(shí)別的所述一種或多種污染物中的每一種,創(chuàng)建基因組途徑酶GPE圖譜,其中,所述GPE圖譜包括在所述DEBG中列出的對(duì)應(yīng)于國(guó)家生物技術(shù)信息中心NCBI報(bào)道的所有微生物基因組的所有微生物名稱、關(guān)于每個(gè)基因組上多個(gè)子途徑的每個(gè)步驟中涉及的每種酶的活性位點(diǎn)的信息,其中,基于第二預(yù)定義標(biāo)準(zhǔn),所述GPE圖譜具有0或1的數(shù)值; 通過利用所述知識(shí)庫中的所述信息,為在所述樣本中識(shí)別的所述一種或多種污染物中的每一種識(shí)別一列部分污染物降解劑和一列完全污染物降解劑,其中,所述部分污染物降解劑是指提供將污染物轉(zhuǎn)化為中間體化合物的一個(gè)或多個(gè)子途徑和對(duì)應(yīng)的一組基因、編碼的蛋白質(zhì)或酶的微生物,其中,多個(gè)部分降解劑組合地提供用于完全降解采集到的所述樣本中識(shí)別的污染物的所有子途徑,其中,完全污染物降解劑具有在用于降解在采集到的所述樣本中識(shí)別的所述污染物的單個(gè)微生物內(nèi)的所有子途徑和對(duì)應(yīng)的一組基因、編碼的蛋白質(zhì)或酶的組合208;使用來自所述知識(shí)庫的信息創(chuàng)建微生物圖譜,其中,所述微生物圖譜包括能夠?qū)⒃谒鰳颖局凶R(shí)別的所述一種或多種污染物中的每種污染物降解至不同的降解程度的、所述部分污染物降解劑和所述完全污染物降解劑中的一種或多種的信息,其中,所述污染物的不同的降解程度是指污染物降解為不同的中間體化合物或代謝物,其中,所述中間體化合物或代謝物由一個(gè)或多個(gè)最終產(chǎn)物確定,所述最終產(chǎn)物是在對(duì)應(yīng)于在降解所述污染物的降解劑的基因組內(nèi)存在的所述子途徑的基因或蛋白質(zhì)或酶的作用下由所述降解劑釋放的,其中,所述中間體化合物能夠被釋放到所述環(huán)境中并由所述環(huán)境中的其他微生物利用或者能夠被同化到進(jìn)行這種降解的相同微生物中210; 使用創(chuàng)建的所述微生物圖譜設(shè)計(jì)第一微生物群落,所述第一微生物群落包括共同提供用于完全降解在所述樣本中識(shí)別的所述一種或多種污染物所需的子途徑的微生物,其中,所述微生物能夠在從中采集所述樣本的相同環(huán)境生態(tài)位中共同存活212; 使用創(chuàng)建的所述微生物圖譜設(shè)計(jì)第二微生物群落,所述第二微生物群落包括共同提供用于將在采集到的所述樣本中識(shí)別的所述一種或多種污染物部分降解為期望的一種或多種中間產(chǎn)物所需的子途徑的基因、蛋白質(zhì)和酶的微生物,其中,形成所述第二微生物群落的所述微生物能夠在從中采集所述樣本的所述環(huán)境生態(tài)位中共同存活214; 對(duì)含有所述一種或多種污染物的環(huán)境場(chǎng)地施用所述第一微生物群落和所述第二微生物群落中的至少一者或二者的混合物216; 檢查所施用的混合物對(duì)消除從所述環(huán)境場(chǎng)地采集的樣本中的一種或多種污染物的功效,其中,通過從采集到的所述樣本中分離和識(shí)別殘余污染物組合來進(jìn)行功效評(píng)估218;以及 在所述環(huán)境場(chǎng)地重新施用新的混合物,其中,通過加入能夠作為部分降解劑并組合地降解在采集到的所述樣本中的所述一種或多種污染物的一組微生物來制備所述新的混合物220。
如需購(gòu)買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人塔塔咨詢服務(wù)有限公司,其通訊地址為:印度馬哈拉施特拉邦;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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