山東大學段曉輝獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉山東大學申請的專利分子動力學鄰接表構建優化方法、系統及超級計算機平臺獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN120388629B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-23發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202510873488.7,技術領域涉及:G16C10/00;該發明授權分子動力學鄰接表構建優化方法、系統及超級計算機平臺是由段曉輝;安會海;高萍;劉衛國設計研發完成,并于2025-06-27向國家知識產權局提交的專利申請。
本分子動力學鄰接表構建優化方法、系統及超級計算機平臺在說明書摘要公布了:本發明屬于分子動力學領域,為解決傳統鄰接表構建時緩存命中率下降等問題,提供了分子動力學鄰接表構建優化方法、系統及超級計算機平臺。分子動力學鄰接表構建優化方法包括將各個物理空間內的原子坐標映射到三維整數網格坐標;對所有原子的三維整數網格坐標進行一維映射編碼并對所有原子進行排序;聚簇排序后的所有原子,得到若干個原子簇并初始化其內的共享狀態;基于初始化的每個原子簇內的共享狀態,構建每個原子簇的候選鄰居區域;根據向量化指令統一遍歷各個原子簇的候選鄰居區域,構建各個原子簇各原子的鄰接表并寫入全局鄰接表中,實現了更大規模、更高效率的分子模擬。
本發明授權分子動力學鄰接表構建優化方法、系統及超級計算機平臺在權利要求書中公布了:1.一種分子動力學鄰接表構建優化方法,其特征在于,包括: 對分子動力學模擬區域進行物理空間劃分,構建物理空間索引,將各個物理空間內的原子坐標映射到三維整數網格坐標; 對所有原子的三維整數網格坐標進行一維映射編碼,并根據一維映射編碼值對所有原子進行排序; 聚簇排序后的所有原子,得到若干個原子簇并初始化其內的共享狀態; 基于初始化的每個原子簇內的共享狀態,構建每個原子簇的候選鄰居區域; 根據向量化指令統一遍歷各個原子簇的候選鄰居區域,構建各個原子簇各原子的鄰接表并寫入全局鄰接表中。
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