華東交通大學李光輝獲國家專利權
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龍圖騰網(wǎng)獲悉華東交通大學申請的專利基于序列-結構雙通道神經(jīng)網(wǎng)絡的抗菌肽識別方法及系統(tǒng)獲國家發(fā)明授權專利權,本發(fā)明授權專利權由國家知識產(chǎn)權局授予,授權公告號為:CN120432006B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權局官網(wǎng)在2025-09-16發(fā)布的發(fā)明授權授權公告中獲悉:該發(fā)明授權的專利申請?zhí)?專利號為:202510938071.4,技術領域涉及:G16B30/00;該發(fā)明授權基于序列-結構雙通道神經(jīng)網(wǎng)絡的抗菌肽識別方法及系統(tǒng)是由李光輝;王煜新;鄧鋒;肖湘設計研發(fā)完成,并于2025-07-08向國家知識產(chǎn)權局提交的專利申請。
本基于序列-結構雙通道神經(jīng)網(wǎng)絡的抗菌肽識別方法及系統(tǒng)在說明書摘要公布了:本發(fā)明公開了一種基于序列?結構雙通道神經(jīng)網(wǎng)絡的抗菌肽識別方法及系統(tǒng),該方法將ProtT5提取的氨基酸特征和氨基酸級手工特征進行拼接,得到肽的嵌入并傳入到多個Transformer塊組成的序列通道來提取肽的序列特征;利用ESM?Fold預測肽的三維結構來構建鄰接圖,將ESM?2獲取的氨基酸特征作為鄰接圖的節(jié)點特征,通過融合多頭圖注意力、殘差網(wǎng)絡、層歸一化和前饋神經(jīng)網(wǎng)絡的結構通道進行逐層提取與增強;對序列特征和結構特征進行最大池化和拼接,然后用于抗菌肽預測。本發(fā)明采用多特征融合策略,同時通過引入抗菌肽的三維結構信息,利用雙通道架構融合序列和結構特征,有效提高了抗菌肽識別的準確性。
本發(fā)明授權基于序列-結構雙通道神經(jīng)網(wǎng)絡的抗菌肽識別方法及系統(tǒng)在權利要求書中公布了:1.一種基于序列-結構雙通道神經(jīng)網(wǎng)絡的抗菌肽識別方法,其特征在于,包括以下步驟: 步驟S1:利用預訓練的蛋白質語言模型ProtT5、ESM-2分別提取肽序列的氨基酸特征,并利用ESM-Fold預測肽的三維結構;還提取肽序列的結構性質特征和理化性質特征組成的氨基酸級手工特征; 步驟S2:將ProtT5提取的氨基酸特征和氨基酸級手工特征進行拼接,得到肽的嵌入并傳入到多個Transformer塊組成的序列通道來提取肽的序列特征; 步驟S3:利用肽的三維結構來構建鄰接圖,將ESM-2提取的氨基酸特征作為鄰接圖的節(jié)點特征,鄰接圖和節(jié)點特征構成肽的圖結構特征輸入結構通道逐層提取結構特征,所述結構通道采用融合多頭圖注意力、殘差網(wǎng)絡、層歸一化和前饋神經(jīng)網(wǎng)絡的圖注意力編碼塊; 步驟S4:對提取的序列特征和結構特征分別進行最大池化,并將池化后的兩個特征進行拼接; 步驟S5:將拼接后的特征輸入到全連接層判斷是抗菌肽還是非抗菌肽。
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