中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院胡元會(huì)獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院申請(qǐng)的專利一種房顫心肌纖維化的分析裝置、方法獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN114388066B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-09-12發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202210106058.9,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B40/30;該發(fā)明授權(quán)一種房顫心肌纖維化的分析裝置、方法是由胡元會(huì);褚瑜光;崔翰明;石晶晶;石樹青;魏藝;王歡設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2022-01-28向國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本一種房顫心肌纖維化的分析裝置、方法在說明書摘要公布了:本發(fā)明涉及一種房顫心肌纖維化的分析裝置和方法,包括空間轉(zhuǎn)錄模塊、表達(dá)變化差異基因篩選模塊、降維處理模塊、聚類分析模塊、聚類差異基因集篩選模塊、主要差異類群篩選模塊和分析模塊;采用空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)對(duì)正常組、模型組動(dòng)物心肌組織切片進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄測(cè)序,利用空間轉(zhuǎn)錄測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行后續(xù)分析,篩選高度變異基因、降維、聚類處理,對(duì)每個(gè)聚類的差異基因進(jìn)行篩選,對(duì)篩選出的各聚類差異基因進(jìn)行富集分析,得到主要差異聚類,最后對(duì)主要差異聚類的差異基因在進(jìn)行富集分析。利用本發(fā)明裝置分析出房顫心房肌纖維化病變機(jī)制中的關(guān)鍵特征基因及相關(guān)分子信號(hào)通路,為更好地了解房顫病變的發(fā)生、發(fā)展過程提供了有效的分子理論基礎(chǔ)和理論支持。
本發(fā)明授權(quán)一種房顫心肌纖維化的分析裝置、方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種房顫心肌纖維化的分析裝置,其特征是,包括: 表達(dá)變化差異基因篩選模塊,用于對(duì)正常組、房顫模型組動(dòng)物心房肌組織切片樣本的空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,并通過vst算法對(duì)標(biāo)準(zhǔn)化處理后的數(shù)據(jù)進(jìn)行高度變異基因篩選,得到表達(dá)變化差異從高到低的表達(dá)變化差異基因集; 降維處理模塊,用于對(duì)正常組、房顫模型組樣本中篩選獲得的表達(dá)變化差異基因集進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理后的數(shù)據(jù)采用PCA方法進(jìn)行線性降維處理,獲得PCA降維數(shù)據(jù);然后采用T-SNE的非線性降維算法對(duì)PCA降維數(shù)據(jù)進(jìn)行非線性降維處理,獲得T-SNE降維數(shù)據(jù); 聚類分析模塊,用于對(duì)降維處理數(shù)據(jù)采用SNN聚類算法進(jìn)行聚類分析處理,獲得正常組、房顫模型組樣本的表達(dá)變化差異基因聚類亞群; 聚類差異基因集篩選模塊,用于采用Seurat軟件的wilcox秩和檢驗(yàn)分別對(duì)正常組、房顫房模型組樣本的每個(gè)聚類亞群的基因與對(duì)應(yīng)組的組織樣本的其他所有聚類亞群的基因進(jìn)行差異比較,篩選獲得每個(gè)聚類的差異基因集,即每個(gè)聚類的表達(dá)差異變化大的基因集; 主要差異類群篩選模塊,用于采用R語言ClusterProfiler包分別對(duì)正常組、房顫模型組樣本的每個(gè)聚類的聚類差異基因集進(jìn)行差異基因富集分析,并將正常組與房顫模型組的富集分析結(jié)果進(jìn)行比較,篩選獲得主要差異類群; 主要差異類群分析模塊,用于對(duì)房顫模型組的主要差異類群與房顫模型組的其他聚類亞群的聚類差異基因集進(jìn)行差異基因功能富集分析,即對(duì)主要差異類群的差異基因進(jìn)行生物學(xué)過程富集分析,即GO注釋系統(tǒng)的生物學(xué)過程分析,獲得導(dǎo)致房顫心肌纖維化涉及衰老、膠原纖維結(jié)合、補(bǔ)體激活、細(xì)胞外基質(zhì)、對(duì)機(jī)械刺激的反應(yīng)過程的生物學(xué)過程; 對(duì)房顫模型組的主要差異類群與房顫模型組的其他聚類亞群的聚類差異基因集進(jìn)行KEGGpathway分析,獲得房顫心肌纖維化與補(bǔ)體系統(tǒng),ECM-受體相互作用,糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號(hào)通路相關(guān),其中所述主要差異類群分析模塊分析的主要差異類群的聚類差異基因集為Nppa,Apoe,Reg3b,Myl4,Bgn,Postn,F(xiàn)tl1,Lbp,lgfbp4和Fn1。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院,其通訊地址為:100053 北京市西城區(qū)北線閣5號(hào);或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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