華中科技大學王超龍獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉華中科技大學申請的專利一種基于DNA甲基化芯片的基因分型方法及應用獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN118136100B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-05發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202410113276.4,技術領域涉及:G16B20/20;該發明授權一種基于DNA甲基化芯片的基因分型方法及應用是由王超龍;姜毅;程姍珊設計研發完成,并于2024-01-26向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種基于DNA甲基化芯片的基因分型方法及應用在說明書摘要公布了:本發明涉及表觀組關聯研究領域,涉及一種基于DNA甲基化芯片的基因分型方法及應用。本發明開發了一個基于Infinium甲基化芯片數據檢測基因型并推斷樣本間親緣關系的方法。該方法以芯片原始數據.IDAT格式或處理后的數據β或M值矩陣當作輸入,針對SNP探針、Ⅰ型探針和Ⅱ型探針分別檢測基因型,并產生標準的VCF文件。本發明首次實現從甲基化芯片數據中準確檢測上千個SNP的基因型,并基于這些基因型實現人群結構和親緣關系的準確推斷。如果在進行表觀組關聯分析EWAS之前使用本方法排除具有親緣關系的樣本,可減少由樣本相關性導致的假陽性結果,提高研究結果的準確性,促進對疾病機制的研究。
本發明授權一種基于DNA甲基化芯片的基因分型方法及應用在權利要求書中公布了:1.一種基于DNA甲基化芯片的基因分型方法,其特征在于,包括以下步驟: 1針對每個候選SNP探針、候選Ⅰ型探針和候選Ⅱ型探針分別計算支持突變等位基因的信號比例RAI,并生成RAI矩陣,其中每個探針在每個樣本中對應一個RAI值; 2針對三種探針分別構建RAI分布的混合模型,所述混合模型包括三個beta分布和一個均勻分布,其中三個beta分布分別表示參考純合子、雜合子和突變純合子這三種基因型,一個均勻分布表示背景噪音; 3對步驟2所述混合模型的參數進行求解,并計算每個探針在每個樣本中的背景概率和參考純合子、雜合子和突變純合子這三種基因型概率值; 4根據步驟3得到的背景概率和三種基因型概率,計算每個探針在每個樣本中的基因型。
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