之江實驗室張莎莎獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉之江實驗室申請的專利基于潛在擴散模型的基因組學跨模態條件生成方法及系統獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN120183507B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-02發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202510618755.6,技術領域涉及:G16B40/00;該發明授權基于潛在擴散模型的基因組學跨模態條件生成方法及系統是由張莎莎;王兆祥;張軍陽設計研發完成,并于2025-05-14向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于潛在擴散模型的基因組學跨模態條件生成方法及系統在說明書摘要公布了:本發明公開了一種基于潛在擴散模型的基因組學跨模態條件生成方法及系統,屬于生物信息學領域,所述方法包括以下步驟:分別針對基因表達和基因突變數據設計構建自編碼器并進行模型訓練,根據基因突變數據的編碼器構建潛在特征空間并訓練無條件引導的潛在擴散模型;根據訓練好的兩個編碼器構建跨模態特征對齊網絡并訓練;將無條件引導的潛在擴散模型和跨模態特征對齊網絡進行聯合微調。本發明解決了多模態學習中樣本模態缺失的問題,通過跨模態特征對齊能夠捕捉基因表達數據和基因突變數據之間的潛在關聯,增強不同模態之間的信息流動,通過潛在擴散模型有效地實現在缺失突變數據時生成高質量的預測數據。
本發明授權基于潛在擴散模型的基因組學跨模態條件生成方法及系統在權利要求書中公布了:1.一種基于潛在擴散模型的基因組學跨模態條件生成方法,其特征在于,包括以下步驟: 分別針對基因表達數據和基因突變數據構建變分自編碼器進行訓練,得到基于基因表達數據的第一編碼器、第一解碼器和基于基因突變數據的第二編碼器、第二解碼器;根據第二編碼器構建潛在特征空間,凍結第二編碼器、第二解碼器參數,訓練無條件引導的潛在擴散模型; 基于注意力機制構建跨模態特征對齊網絡,凍結第一編碼器、第二編碼器參數,將基因表達數據基于第一編碼器得到的潛在表征輸入跨模態特征對齊網絡后,與基因突變數據基于第二編碼器得到的潛在表征進行特征對齊,訓練跨模態特征對齊網絡; 將無條件引導的潛在擴散模型和跨模態特征對齊網絡進行聯合微調,將跨模態特征對齊網絡的輸出作為潛在擴散模型的引導條件; 在利用基因表達數據生成對應的基因突變數據時,將基因表達數據依次通過訓練好的第一編碼器和跨模態特征對齊網絡后,輸入潛在擴散模型進行噪聲初始化和迭代去噪,通過第二解碼器解碼,生成基因突變數據。
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