中國科學技術大學劉海燕獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中國科學技術大學申請的專利不使用模板從頭設計蛋白質的方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN113870943B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-29發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202111197820.0,技術領域涉及:G16B15/20;該發明授權不使用模板從頭設計蛋白質的方法是由劉海燕;陳泉;黃斌;許洋;胡秀紅設計研發完成,并于2021-10-14向國家知識產權局提交的專利申請。
本不使用模板從頭設計蛋白質的方法在說明書摘要公布了:本發明涉及一種對蛋白質的部分或全部進行從頭設計的方法,所述方法包括:a.產生可設計性高的主鏈結構;b.氨基酸序列選擇和主鏈修正迭代。該方法能夠用預先指定的特征作為約束條件生成待設計蛋白的主鏈空間結構,進而確定待設計蛋白的氨基酸序列,使待設計蛋白具有預先指定的特征;該方法生成待設計蛋白主鏈空間結構時不需要用已知的具體蛋白質局部片段作為結構模板去拼接產生待設計蛋白結構,而是用計算機優化從大量天然蛋白結構學習得到的數學模型統計能量函數模型。
本發明授權不使用模板從頭設計蛋白質的方法在權利要求書中公布了:1.蛋白質從頭設計方法,其特征在于,所述方法包括: a.產生可設計性高的主鏈結構; b.氨基酸序列選擇和主鏈修正迭代; 其中,產生可設計性高的主鏈結構包括:采用聚焦主鏈的統計能量函數SCUBA為目標函數,在序列待定的情況下,用計算方法對主鏈結構進行優化,找到SCUBA總能量極小的穩定主鏈結構, 用計算方法對主鏈結構進行優化包括子階段1和子階段2, 在所述子階段1中,指定的螺旋或β鏈片段的局部構象受到二級結構類型約束,涉及環區原子的空間相互作用乘以0.01倍; 在所述子階段2中,去除了局部構象二級結構類型限制,并將涉及環殘基的相互作用恢復到完全強度。
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