南京大學(xué)張峻峰獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉南京大學(xué)申請的專利小分子藥物蛋白-配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和親和力估計方法獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN115083514B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-08-29發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202210869564.3,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B15/00;該發(fā)明授權(quán)小分子藥物蛋白-配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和親和力估計方法是由張峻峰;何克磊;董鐵軍;吳錦慧設(shè)計研發(fā)完成,并于2022-07-21向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本小分子藥物蛋白-配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和親和力估計方法在說明書摘要公布了:本發(fā)明公開了一種小分子藥物蛋白?配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和親和力估計方法,包括以下步驟:構(gòu)建蛋白?配體圖,提取和更新所述蛋白?配體圖的特征,獲取特征更新模塊;結(jié)合所述特征更新模塊與親和力估計模塊進行親和力估計,獲取蛋白?配體親和力;結(jié)合所述特征更新模塊與結(jié)構(gòu)預(yù)測模塊進行復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測,獲取蛋白?配體三維結(jié)構(gòu);構(gòu)建蛋白?配體網(wǎng)絡(luò)模型,基于所述蛋白?配體親和力和所述蛋白?配體三維結(jié)構(gòu)訓(xùn)練所述蛋白?配體網(wǎng)絡(luò)模型,調(diào)整網(wǎng)絡(luò)參數(shù),完成結(jié)構(gòu)預(yù)測。本發(fā)明提高了預(yù)測精度和準確度。
本發(fā)明授權(quán)小分子藥物蛋白-配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和親和力估計方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種小分子藥物蛋白-配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和親和力估計方法,其特征在于,包括以下步驟: 構(gòu)建蛋白-配體圖,利用特征更新模塊,提取和更新所述蛋白-配體圖的特征; 結(jié)合所述特征更新模塊與結(jié)構(gòu)預(yù)測模塊進行復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測,獲取蛋白-配體三維結(jié)構(gòu);結(jié)合所述特征更新模塊與親和力估計模塊進行親和力估計,獲取蛋白-配體親和力; 構(gòu)建蛋白-配體網(wǎng)絡(luò)模型,基于所述蛋白-配體三維結(jié)構(gòu)和所述蛋白-配體親和力訓(xùn)練所述蛋白-配體網(wǎng)絡(luò)模型,調(diào)整網(wǎng)絡(luò)參數(shù),完成預(yù)測; 所述蛋白-配體圖包括完全圖和異構(gòu)圖; 所述完全圖包括:根據(jù)給定的蛋白-配體對,構(gòu)建一個雙向的完全圖,其中每個節(jié)點表示一個原子,每個所述原子與其他的所述原子均相互連接表示為所述完全圖;完全圖由一組向量存儲每個節(jié)點的特征,一組矩陣存儲邊的特征; 所述異構(gòu)圖包括:根據(jù)給定的蛋白-配體對,將蛋白與配體小分子全連接表示為所述異構(gòu)圖; 獲取特征更新模塊包括:信息聚合和信息前饋; 所述信息聚合包括:更新中心節(jié)點的特征,獲取聚合后的所述中心節(jié)點的特征;將所述特征更新模塊中的每個中心節(jié)點接受到的前饋信息進行聚合,得到新的特征和坐標信息; 所述信息前饋包括:將所述特征更新模塊中的每個中心節(jié)點的周圍鄰接節(jié)點的特征和坐標信息傳遞到中心節(jié)點; 所述親和力估計的過程包括: 將節(jié)點特征更新輸出經(jīng)過一個兩層的多層感知器,對每個蛋白-配體對得到單維的親和力預(yù)測,計算如下: 其中yaff是對該蛋白-配體對的親和力預(yù)測,Nf表示圖節(jié)點的數(shù)目。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人南京大學(xué),其通訊地址為:210093 江蘇省南京市棲霞區(qū)仙林大道163號;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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