上海交通大學;上海迪贏生物科技有限公司師詠勇獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉上海交通大學;上海迪贏生物科技有限公司申請的專利基于空間交錯編碼多組學芯片及其制備方法與應用獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115386965B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-29發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202211046021.8,技術領域涉及:C40B50/06;該發明授權基于空間交錯編碼多組學芯片及其制備方法與應用是由師詠勇;張滿倉;陳建;陳興華設計研發完成,并于2022-08-30向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于空間交錯編碼多組學芯片及其制備方法與應用在說明書摘要公布了:本發明公開了基于空間交錯編碼多組學芯片及其制備方法與應用。本發明基于3D噴墨原位DNA合成技術利用空間交錯編碼策略制作高分辨率的大尺度空間多組學芯片,進而使用空間原位捕獲策略對組織切片進行高通量的原位轉錄組分析、原位表觀組分析、原位非編碼RNA分析和原位蛋白組分析;實現了單細胞分辨率、大尺度空間覆蓋,同時兼顧高的基因數目檢出率;可用于器官或組織的三維全覆蓋精確轉錄圖譜或時空圖譜構建。
本發明授權基于空間交錯編碼多組學芯片及其制備方法與應用在權利要求書中公布了:1.一種基于空間交錯編碼多組學芯片的原位制備方法,包括如下步驟: 1)將基底用水虎魚溶液進行表面處理然后等離子清洗,得到預處理的基底; 2)將所述預處理的基底用親水性硅烷和疏水性硅烷的混合液浸泡,然后進行蒸鍍或CVD表面處理;再依次加入Spacer試劑、Unylinker分子處理,得到表面處理的功能圖案化芯片; 3)在所述表面處理的功能圖案化芯片上通過高通量原位噴墨打印合成平臺合成用于空間多組學分析的序列,得到空間轉錄組芯片; 所述表面處理的功能圖案化芯片上包含三類Spot區域,分別為1區Spot、2區Spot和3區Spot; 所述2區定義為兩個相鄰圓形像素點交集部分,所述3區定義為三個相鄰圓形交集的區域,所述1區定義為剩余未交集部分; 所述1區的空間坐標條形碼的長度為n,則所述2區的空間坐標條形碼長度為2n,所述3區的空間坐標條形碼長度為3n,n為堿基數; 步驟3)中包括打開控制電腦將所述高通量原位噴墨打印合成平臺中將如下合成序列輸入高通量DNA合成控制軟件: 每個所述Spot區域的序列從3端到5端依次為通用序列、空間編碼序列、分子標簽序列和搭橋序列; 在整個所述表面處理的功能圖案化芯片上,所有Spot序列中通用序列、分子標簽序列和搭橋序列均相同,采用FlowCell部件進行通用合成; 每個所述Spot區域的序列包含一個唯一的空間編碼序列,所述空間編碼序列部分的合成由壓電噴墨打印嵌套合成策略進行合成; 4)將所述空間轉錄組芯片經過氨解脫去保護堿基處理后,得到蜂窩狀全覆蓋空間轉錄組芯片; 5)將所述蜂窩狀全覆蓋空間轉錄組芯片進行CaptureOligo雜交反應; 6)將和步驟5)中經探針轉換的芯片利用無5’-3’外切酶活性、無3’-5’外切酶活性和無鏈置換活性的聚合酶和連接酶進行探針延伸和連接; 7)將經步驟6)處理的芯片清洗,即得到基于空間交錯編碼空間多組學芯片。
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