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龍圖騰網(wǎng)獲悉廈門大學(xué)申請(qǐng)的專利一種融合基因和序列信息的適應(yīng)性免疫受體預(yù)測(cè)方法獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán)，本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予，授權(quán)公告號(hào)為：CN116052779B 。

龍圖騰網(wǎng)通過國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-08-29發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉：該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為：202310062002.2，技術(shù)領(lǐng)域涉及：G16B40/00；該發(fā)明授權(quán)一種融合基因和序列信息的適應(yīng)性免疫受體預(yù)測(cè)方法是由蘇小娜;俞容山;趙宇;姚建華設(shè)計(jì)研發(fā)完成，并于2023-01-16向國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。

本一種融合基因和序列信息的適應(yīng)性免疫受體預(yù)測(cè)方法在說明書摘要公布了：本發(fā)明公開了一種融合基因和序列信息的適應(yīng)性免疫受體預(yù)測(cè)方法，包括以下步驟：S1、將SC?AIR?BERT模型進(jìn)行修改，構(gòu)建SC?AIR?BERT?Multi模型；所述SC?AIR?BERT?Multi模型含有一個(gè)基因信息提取通道、一個(gè)序列信息提取通道、一個(gè)多模態(tài)融合模塊，以及兩個(gè)用于進(jìn)行多任務(wù)學(xué)習(xí)的多層感知器；S2、在基因信息提取通道中，以基因名稱作為輸入，得到免疫細(xì)胞受體的基因特征hgene；S3、在序列信息提取通道中，以TCR序列或BCR序列為輸入，得到免疫細(xì)胞受體的序列特征hseq；S4、將V、D、J基因片段的基因特征和序列特征送入多模態(tài)特征融合模塊進(jìn)行融合，并產(chǎn)生融合后的特征；S5、通過兩個(gè)多層感知器將步驟S4中學(xué)習(xí)到多模態(tài)的受體特征Representation映射到最終的TCR或BCR抗原結(jié)合特異性預(yù)測(cè)和親和力預(yù)測(cè)的結(jié)果進(jìn)行預(yù)測(cè)。

本發(fā)明授權(quán)一種融合基因和序列信息的適應(yīng)性免疫受體預(yù)測(cè)方法在權(quán)利要求書中公布了：1.一種融合基因和序列信息的適應(yīng)性免疫受體預(yù)測(cè)方法，其特征在于，包括以下步驟： S1、將SC-AIR-BERT模型進(jìn)行修改，構(gòu)建SC-AIR-BERT-Multi模型；所述SC-AIR-BERT-Multi模型含有一個(gè)基因信息提取通道、一個(gè)序列信息提取通道、一個(gè)多模態(tài)融合模塊，以及兩個(gè)用于進(jìn)行多任務(wù)學(xué)習(xí)的多層感知器； 步驟S1中所述SC-AIR-BERT模型的修改過程為： S11、修改BERT網(wǎng)絡(luò)：由于TCR或BCR兩條鏈的配對(duì)是相對(duì)隨機(jī)的，將BERT模型的NSP任務(wù)去除，只保留MLM任務(wù)； S12、修改mask策略：由于采用kmer序列作為輸入數(shù)據(jù)，詞和詞之間會(huì)有兩個(gè)氨基酸的重疊，在mask掉某個(gè)kmer時(shí)，同時(shí)mask其左右兩個(gè)詞，防止模型訓(xùn)練過快地收斂； S2、在基因信息提取通道中，以基因名稱作為輸入，得到免疫細(xì)胞受體的基因特征hgene； S3、在序列信息提取通道中，以TCR序列或BCR序列為輸入，得到免疫細(xì)胞受體的序列特征hseq； S4、將V、D、J基因片段的基因特征和序列特征送入多模態(tài)特征融合模塊進(jìn)行融合，并產(chǎn)生融合后的特征； 步驟S4中所述多模態(tài)特征融合模塊包括門控注意力機(jī)制和張量融合機(jī)制，門控注意力機(jī)制用于加權(quán)和過濾各個(gè)模態(tài)的特征，張量融合機(jī)制用于產(chǎn)生融合后的整體多模態(tài)特征；步驟S4的具體過程為： S41、基于門控注意力機(jī)制，將免疫細(xì)胞受體在步驟S2中獲得的基因特征hgene以及步驟S3中獲得的序列特征hseq進(jìn)行加權(quán)融合，得到該免疫細(xì)胞受體目標(biāo)基因特征hˋgene和目標(biāo)序列特征hˋseq； S42、將目標(biāo)基因特征hˋgene與目標(biāo)序列特征hˋseq相乘，得到該免疫細(xì)胞受體的初始受體特征hfusion，即該過程為免疫細(xì)胞受體張量融合過程； S43、對(duì)初始受體特征hfusion進(jìn)行兩次全連接FC1，F(xiàn)C2，得到該免疫細(xì)胞的受體特征Representation； S5、通過兩個(gè)多層感知器將步驟S4中學(xué)習(xí)到多模態(tài)的受體特征Representation映射到最終的TCR或BCR抗原結(jié)合特異性預(yù)測(cè)和親和力預(yù)測(cè)的結(jié)果中，進(jìn)行抗原結(jié)合特異性預(yù)測(cè)和親和力預(yù)測(cè)。

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