海南大學張世麟獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉海南大學申請的專利針對空間轉錄組數據的空間組織結構的識別方法及裝置獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119673270B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-26發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202411740995.5,技術領域涉及:G16B20/00;該發明授權針對空間轉錄組數據的空間組織結構的識別方法及裝置是由張世麟;張清辰設計研發完成,并于2024-11-29向國家知識產權局提交的專利申請。
本針對空間轉錄組數據的空間組織結構的識別方法及裝置在說明書摘要公布了:本申請公開了一種針對空間轉錄組數據的空間組織結構的識別方法及裝置。該方案中,通過獲取待識別的樣本組織的空間轉錄組數據對應的基因表達矩陣和鄰接矩陣;基于基因表達矩陣和鄰接矩陣構建樣本圖;將樣本圖輸入至圖采樣聚合網絡模型中,通過圖采樣聚合網絡模型對樣本圖中每個節點的鄰域中的鄰居節點的基因特征數據與該節點的基因特征數據進行特征聚合,得到樣本圖的特征表征;依據特征表征獲取樣本組織對應的空間組織結構的識別結果。本申請技術方案能夠在節點的特征聚合過程中,實現充分利用空間位置上相鄰的兩個節點之間的基因表達數據的相似性信息,從而提高了對組織樣本的空間組織結構識別的準確率。
本發明授權針對空間轉錄組數據的空間組織結構的識別方法及裝置在權利要求書中公布了:1.一種針對空間轉錄組數據的空間組織結構的識別方法,其特征在于,包括: 獲取待識別的樣本組織的空間轉錄組數據對應的基因表達矩陣和鄰接矩陣,其中,所述基因表達矩陣為由所述空間轉錄組數據中的基因表達數據確定的矩陣,所述鄰接矩陣為由所述基因表達數據對應的空間位置信息確定的矩陣; 基于所述基因表達矩陣和所述鄰接矩陣構建樣本圖,其中,所述樣本圖為描述相鄰節點之間的基因表達數據的相似性關系的無向圖; 將所述樣本圖輸入至圖采樣聚合網絡模型中,通過所述圖采樣聚合網絡模型對所述樣本圖中每個所述節點的鄰域中的鄰居節點的基因特征數據與該節點的基因特征數據進行特征聚合,得到所述樣本圖的特征表征,其中,每個所述節點的鄰域中的鄰居節點包括與該節點直接相鄰或間接相鄰的節點; 依據所述特征表征獲取所述樣本組織對應的空間組織結構的識別結果; 所述通過所述圖采樣聚合網絡模型對所述樣本圖中每個所述節點的鄰域中的鄰居節點的基因特征數據與該節點的基因特征數據進行特征聚合,得到所述樣本圖的特征表征,包括: 執行特征提取操作,以從所述樣本圖中的第i個所述節點開始,通過迭代的方式逐階提取第i個所述節點的鄰域中的M個一階鄰居節點的基因特征數據和L個二階鄰居節點的基因特征數據,其中,所述一階鄰居節點與第i個所述節點相鄰,所述二階鄰居節點與第i個所述節點對應的一階鄰居節點相鄰,M和L均為正整數; 執行特征聚合操作,以對M個所述一階鄰居節點的基因特征數據進行特征聚合,得到第一聚合特征;以及,對L個所述二階鄰居節點的基因特征數據進行特征聚合,得到第二聚合特征; 執行特征拼接操作,以將所述第一聚合特征、所述第二聚合特征與第i個所述節點的基因特征數據進行拼接,得到第i個所述節點的嵌入特征; 多次執行所述特征提取操作、所述特征聚合操作以及所述特征拼接操作,直至獲得所述樣本圖中的N個所述節點分別對應的嵌入特征,并基于N個所述節點分別對應的嵌入特征構建所述特征表征,其中,N為正整數。
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