華東交通大學張偉獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉華東交通大學申請的專利基于非負矩陣分解框架的預測蛋白質相互作用關系的方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115116551B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-29發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202210743745.1,技術領域涉及:G16B50/30;該發明授權基于非負矩陣分解框架的預測蛋白質相互作用關系的方法是由張偉;蔡嫻嫻;徐亞新設計研發完成,并于2022-06-27向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于非負矩陣分解框架的預測蛋白質相互作用關系的方法在說明書摘要公布了:本發明公開了一種基于非負矩陣分解框架的預測蛋白質相互作用關系的計算方法。該方法有效融合蛋白質相互作用數據的拓撲結構特征以及蛋白質的本體語義相似度信息;將這兩種信息融入非負矩陣分解方法框架中,通過迭代求解非負矩陣分解的結果,得到蛋白質之間連接關系相似度矩陣;最后通過亞細胞定位信息矩陣進行過濾,得到未知連接關系的蛋白質之間相似度值,相似度越大,意味著這兩個蛋白質之間存在相互作用的可能性越大。經測試驗證,本發明提出的方法可以顯著提高預測未知蛋白質相互作用關系的精度和效率。
本發明授權基于非負矩陣分解框架的預測蛋白質相互作用關系的方法在權利要求書中公布了:1.一種基于非負矩陣分解框架的預測蛋白質相互作用關系的方法,該方法包括以下步驟: 1獲取已有蛋白質相互作用關系數據、基因本體語義注釋信息數據及蛋白質亞細胞定位數據; 2基于已有蛋白質相互作用關系數據構建鄰接矩陣A,基于基因本體語義注釋信息數據構建蛋白質與蛋白質間的基因功能相似性矩陣S,基于蛋白質亞細胞定位數據構建蛋白質間的亞細胞定位信息鄰接矩陣SL_adj; 3定義一個基于非負矩陣分解框架的目標函數: (1) 其中,A表示鄰接矩陣,,及,S表示基因功能相似性矩陣,表示Frobenius范數,A表示求矩陣A的跡,表示權重參數,分別為防止過擬合的正則化參數,p為1-2間的參數,L=D-C,C為鄰接矩陣A的余弦相似性矩陣,; 4建立增廣的拉格朗日函數,使用基于迭代優化的方法來優化目標函數值; 5獲得迭代優化后的W,H1,計算未知連接關系的蛋白質之間連接相似度值; 6將未知連接關系蛋白質之間的相似度值按照從大到小排序,排序的前k個最大相似值對應的連接關系即為預測的蛋白質相互作用關系。
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