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龍圖騰網獲悉合肥綜合性國家科學中心人工智能研究院(安徽省人工智能實驗室)申請的專利一種用于多輪次空間轉錄組成像的探針設計方法及系統獲國家發明授權專利權，本發明授權專利權由國家知識產權局授予，授權公告號為：CN120220832B 。

龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-26發布的發明授權授權公告中獲悉：該發明授權的專利申請號/專利號為：202510695492.9，技術領域涉及：G16B50/30；該發明授權一種用于多輪次空間轉錄組成像的探針設計方法及系統是由方明昊;戴大海;項泉智;沈業欣設計研發完成，并于2025-05-28向國家知識產權局提交的專利申請。

本一種用于多輪次空間轉錄組成像的探針設計方法及系統在說明書摘要公布了：本發明公開了一種用于多輪次空間轉錄組成像的探針設計方法及系統，涉及生物信息學技術領域，包括：構建檢索數據庫；從已知RNA序列中遍歷獲取同一基因所有的isoform的靶向區段并預處理，將所得到的候選探針序列分成兩段進行額外的非特異性檢測，得到所有isoform的靶向探針序列，再根據檢索數據庫中所有表達矩陣篩選得到靶向區域探針；通過隨機ATCG生成多條隨機序列并預處理，據以設計非靶向區域探針；從檢索數據庫獲取單細胞表達矩陣，基于模擬退火算法優化給定基因集在不同成像輪次間的細胞類型層面表達量方差最小，得到基因編碼本；該探針設計方法及系統，對于探針整體的捕獲效率有一定的提升同時兼容多種編碼策略。

本發明授權一種用于多輪次空間轉錄組成像的探針設計方法及系統在權利要求書中公布了：1.一種用于多輪次空間轉錄組成像的探針設計方法，其特征在于，包括： 從GEO數據庫中下載原始fastq數據并預處理得到isoform和基因的表達矩陣，兼顧單細胞表達矩陣，據以構建bulkRNA和scRNA的檢索數據庫； 設計靶向區域探針：從已知RNA序列中遍歷獲取同一基因所有isoform的靶向區段并預處理，將所得到的候選探針序列分成兩段進行額外的非特異性檢測，得到所有isoform的靶向探針序列，再根據檢索數據庫中所有的表達矩陣篩選得到靶向區域探針； 設計非靶向區域探針：通過隨機ATCG生成多條隨機序列并預處理，據以設計非靶向區域探針； 基因編碼本優化：從檢索數據庫中獲得給定基因集在設定物種組織中的bulkRNA的千堿基每百萬測序數表達量和scRNA細胞類型層面平均原始計數的表達量；表達水平超過表達上限閾值和表達水平低于表達下限閾值的基因均不允許加入編碼輪次，篩選得到基因集用于進行編碼本設計并后續進行編碼成像實驗；設置編碼輪次數目以及編碼成像基因個數，對篩選后基因集在輪次通道間的分布進行迭代優化；在每一迭代中，從四種交換策略中隨機選擇一種對篩選后基因集分布處理；若基因集分布在采用交換策略后的方差小于交換前的方差則進入下一輪次，其中方差為該基因集分布下對每個輪次高亮的不同基因組合根據scRNA細胞類型層面的表達量矩陣計算總數，再計算每個輪次間的該總數的平均方差；若采用交換策略后的方差大于交換前的方差，則通過隨機生成數值判斷是否小于，其中，為交換策略前后方差差值，為退火的溫度，隨著迭代次數進行衰減；若小于則進入下一輪次，反之則重新選擇交換策略直至滿足迭代要求； 基因空間展示：利用靶向區域探針、非靶向區域探針和基因編碼本進行多輪次空間轉錄組成像，得到根據基因編碼本解碼后的基因空間展示。

如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術，可聯系本專利的申請人或專利權人合肥綜合性國家科學中心人工智能研究院(安徽省人工智能實驗室)，其通訊地址為：230000 安徽省合肥市高新區望江西路5089號,中國科學技術大學先進技術研究院未來中心B1205-B1208；或者聯系龍圖騰網官方客服，聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。