中國農業科學院植物保護研究所周煥斌獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中國農業科學院植物保護研究所申請的專利一種分析轉基因植物中DNA整合信息的方法及用途獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN114743595B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-23發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202210384790.2,技術領域涉及:G16B20/20;該發明授權一種分析轉基因植物中DNA整合信息的方法及用途是由周煥斌;李少芳設計研發完成,并于2022-04-13向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種分析轉基因植物中DNA整合信息的方法及用途在說明書摘要公布了:本發明屬于生物信息處理領域,公開了分析轉基因植物中DNA整合信息的方法及用途,包括如下步驟:將轉基因植物的基因組測序序列分別與植物的基因組序列和轉基因載體序列對比,篩選比對到植物基因組和轉基因載體序列的SCR;根據SCR對比位置將SCR分組;每個SCR分組中每條SCR未被比對的序列部分按照序列長度從長到短排列,如果短序列出現在長序列中,則短序列與長序列屬于一個SCR亞組;每個SCR亞組中最長的未比到轉基因載體的序列部分精確比對植物基因組和轉基因載體序列,根據SCR亞組比對到轉基因載體和植物基因組的信息獲得轉基因插入位點信息。本發明的方法可以評估轉基因植物多種插入情形等插入片段分子特征。
本發明授權一種分析轉基因植物中DNA整合信息的方法及用途在權利要求書中公布了:1.一種分析轉基因植物中DNA整合信息的方法,其特征在于, 包括如下步驟: 步驟1:將所述轉基因植物的基因組測序序列分別與所述植物的基因組序列和轉基因載體序列比對,然后篩選比對到所述植物基因組和所述轉基因載體序列的SCR; 步驟2:根據SCR比對到所述植物基因組和所述轉基因載體的位置將SCR分組;每個SCR分組中每條SCR未被比對的序列部分按照序列長度從長到短排列,如果短序列出現在長序列中,則所述短序列與所述長序列屬于一個SCR亞組,否則所述短序列成為新的SCR亞組; 步驟3: 比對到所述轉基因載體序列的SCR分組中的每個SCR亞組中最長的未比對到所述轉基因載體的序列部分精確比對所述植物基因組,比對到所述植物基因組的SCR分組中的每個SCR亞組中最長的未比對到所述植物基因組的序列部分精確比對所述轉基因載體序列,根據所述SCR亞組比對到所述轉基因載體和所述植物基因組的信息獲得轉基因插入位點信息; 將比對到所述植物基因組的SCR分組中的每個SCR亞組中最長的未比對到所述植物基因組的序列部分精確比對所述植物基因組序列;如果所述SCR亞組中最長的未比對到植物基因組的序列部分精確比對到所述植物基因組,則根據該SCR亞組信息以及所述轉基因插入位點信息,獲得轉基因引起的所述轉基因植物染色體重排信息; 將比對到所述轉基因載體序列的SCR分組中每個SCR亞組中最長的未比對到所述轉基因載體的序列部分精確比對所述轉基因載體序列;如果所述SCR亞組中最長的未比對到轉基因載體的序列部分精確比對到所述轉基因載體,則根據該SCR亞組信息以及所述插入位點信息獲得轉基因載體片段串聯插入信息。
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