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龍圖騰網獲悉上海快序生物科技有限公司申請的專利一種判斷細胞中腫瘤新抗原肽段質譜鑒定可靠性的方法及其應用獲國家發明授權專利權，本發明授權專利權由國家知識產權局授予，授權公告號為：CN120412757B 。

龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-16發布的發明授權授權公告中獲悉：該發明授權的專利申請號/專利號為：202510897732.3，技術領域涉及：G16B40/10；該發明授權一種判斷細胞中腫瘤新抗原肽段質譜鑒定可靠性的方法及其應用是由朱明;閔恬;沈劍橋;馬斌設計研發完成，并于2025-07-01向國家知識產權局提交的專利申請。

本一種判斷細胞中腫瘤新抗原肽段質譜鑒定可靠性的方法及其應用在說明書摘要公布了：本發明提供了一種判斷細胞中腫瘤新抗原肽段質譜鑒定可靠性的方法及其應用，所述方法包括：基于腫瘤新抗原質譜鑒定實驗的歷史數據構建模型，基于所述模型對陽性組和陰性組進行打分，基于打分值計算陽性組和陰性組的分界閾值；利用訓練好的模型對待測樣品進行打分，將打分值與分界閾值進行比較，進而判斷待測細胞樣品進行腫瘤新抗原肽段質譜鑒定實驗的可靠性。

本發明授權一種判斷細胞中腫瘤新抗原肽段質譜鑒定可靠性的方法及其應用在權利要求書中公布了：1.一種判斷細胞中腫瘤新抗原肽段質譜鑒定可靠性的方法，其特征在于，所述方法包括： 獲取歷史數據，獲取基于質譜實驗檢測的細胞中MHCI蛋白和目標蛋白的表達量統計結果，以及對應細胞的腫瘤新抗原肽段質譜鑒定結果；將歷史數據以腫瘤新抗原質譜鑒定實驗是否能鑒定到來自于目標蛋白的肽段為標準，分為陽性組和陰性組；所述MHCI蛋白和目標蛋白的表達量統計結果的計算方法包括：通過質譜數據分析軟件搜庫，得到MHCI蛋白和目標蛋白對應的二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數；將搜庫得到的其他蛋白按照對應的二級譜圖數量進行排序并取前10%，計算其對應的二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數的平均值，用上述平均值歸一化不同細胞樣品間MHCI蛋白和目標蛋白的二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數，并將歸一化后的值作為表達量統計結果； 所述歸一化的計算公式如下所示： ； 式中，為MHCI蛋白和目標蛋白的二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數；為MHCI蛋白和目標蛋白之外的，二級譜圖數量排在前10%的其他蛋白的二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數的平均值；為歸一化后的MHCI蛋白和目標蛋白的二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數； 構建模型，將陽性組和陰性組的歷史數據作為訓練集，訓練集中的特征向量為質譜實驗中鑒定到的MHCI蛋白和目標蛋白的表達量統計結果；使用隨機梯度下降分類器構建模型，損失函數為對數損失函數，采用十折交叉驗證和L1正則化來避免過擬合；基于所述模型對陽性組和陰性組進行打分，基于打分值計算陽性組和陰性組的分界閾值；所述分界閾值的計算方法為：在訓練集上所有可能的取值中，通過不斷調整閾值，計算不同閾值下樣本的真陽性率和假陽性率，以真陽性率減去假陽性率的差值最大時的閾值為分界閾值； 可靠性預測，利用訓練好的模型對待測樣品進行打分，所述對待測樣品進行打分的步驟包括：基于質譜實驗檢測待測樣品細胞中MHCI蛋白和目標蛋白的表達量統計結果，所述表達量統計結果包括：二級譜圖數量、覆蓋率和置信度分數，將表達量統計結果輸入模型中進行計算打分；將打分值與分界閾值進行比較，判斷待測細胞樣品進行腫瘤新抗原肽段質譜鑒定實驗的可靠性。

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