中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所謝菁忠獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所申請的專利一種植物與病原菌基因互作的雙向關聯(lián)分析方法及應用獲國家發(fā)明授權專利權,本發(fā)明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN120108498B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-09-02發(fā)布的發(fā)明授權授權公告中獲悉:該發(fā)明授權的專利申請?zhí)?專利號為:202510172093.4,技術領域涉及:G16B20/50;該發(fā)明授權一種植物與病原菌基因互作的雙向關聯(lián)分析方法及應用是由謝菁忠;趙彩虹;賀飛;羅巧玲;王利敏;尹謀;王豪杰;王一波設計研發(fā)完成,并于2025-02-17向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種植物與病原菌基因互作的雙向關聯(lián)分析方法及應用在說明書摘要公布了:本發(fā)明公開了一種植物與病原菌基因互作的雙向關聯(lián)分析方法及應用,屬于生物技術領域。包括以下步驟:(1)獲得植物的遺傳變異信息,病原菌的遺傳變異信息和植物對病原菌的抗感表型;(2)正向全基因組關聯(lián)分析,從植物抗病基因出發(fā)定位病原菌效應因子;(3)反向全基因組關聯(lián)分析,從病原菌效應因子出發(fā)定位植物抗病基因;(4)正向全基因組關聯(lián)分析和反向全基因組關聯(lián)分析得到的抗病基因與效應因子相同,二者即為植物與病原菌中互作的基因對。本發(fā)明提供的方法能夠高效、準確并且同時篩選出植物抗病基因與病原菌效應因子的互作基因對,為解析植物抗病基因發(fā)揮的抗性機制提供有力的支持,并為培育持久和廣譜的抗病植物新品種奠定基礎。
本發(fā)明授權一種植物與病原菌基因互作的雙向關聯(lián)分析方法及應用在權利要求書中公布了:1.一種植物與病原菌基因互作的雙向關聯(lián)分析方法,其特征在于,包括以下步驟: (1)獲得植物的遺傳變異信息、病原菌的遺傳變異信息和植物對病原菌的抗感表型;所述植物的遺傳變異信息為單核苷酸多態(tài)性,所述病原菌的遺傳變異信息為單核苷酸多態(tài)性; (2)正向全基因組關聯(lián)分析,從植物抗病基因出發(fā)定位病原菌效應因子: ①對所述植物的遺傳變異信息和植物對病原菌的抗感表型進行全基因組關聯(lián)分析,得到植物基因組上的變異位點與植物對病原菌抗感表型的關聯(lián)結果,繪制曼哈頓圖并識別候選峰; ②從候選峰中識別出植物中的候選抗病基因; ③結合植物對病原菌的抗感表型,鑒定出候選抗病基因的抗病單倍型;具體操作為:候選抗病基因上相鄰的SNP位點串在一起組合成候選抗病基因的單倍型,將基因的不同單倍型與植物對病原菌的抗感表型使用卡方檢驗、邏輯回歸、方差分析和或Kruskal-Wallis檢驗進行關聯(lián)分析,評估單倍型與表型之間的關聯(lián)顯著性,選出候選抗病基因的抗病單倍型; ④將病原菌對含有候選抗病基因的抗病單倍型的植株的侵染表型作為性狀,將所述性狀與病原菌的遺傳變異信息進行全基因組關聯(lián)分析,定位出病原菌基因組上的候選效應因子; (3)反向全基因組關聯(lián)分析,從病原菌效應因子出發(fā)定位植物抗病: ①對所述病原菌的遺傳變異信息和植物對病原菌的抗感表型進行全基因組關聯(lián)分析,得到病原菌基因組上的變異位點與植物對病原菌抗感表型的關聯(lián)結果,繪制曼哈頓圖并識別候選峰; ②從候選峰中識別出病原菌中的候選效應因子; ③結合植物對病原菌的抗感表型,鑒定出候選效應因子的無毒單倍型; ④將植物對含有候選效應因子的無毒單倍型的菌株的抗感表型作為性狀,將所述性狀與植物的遺傳變異信息進行全基因組關聯(lián)分析,定位出植物基因組上的候選抗病基因; (4)所述步驟(2)和所述步驟(3)得到的候選抗病基因與候選效應因子相同,二者即為植物與病原菌中互作的基因對。
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