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          清華珠三角研究院;賽業(廣州)生物科技有限公司陳沛逸獲國家專利權

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          龍圖騰網獲悉清華珠三角研究院;賽業(廣州)生物科技有限公司申請的專利一種AAV衣殼蛋白的設計方法、系統、裝置及存儲介質獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN117153255B

          龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-29發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202311087025.5,技術領域涉及:G16B20/50;該發明授權一種AAV衣殼蛋白的設計方法、系統、裝置及存儲介質是由陳沛逸;劉華清;周淑仙設計研發完成,并于2023-08-25向國家知識產權局提交的專利申請。

          一種AAV衣殼蛋白的設計方法、系統、裝置及存儲介質在說明書摘要公布了:本發明公開了一種AAV衣殼蛋白的設計方法、系統、裝置及存儲介質,包括:根據預設溫度設定初始溫度,初始溫度表征初始AAV序列各個位置的突變可能性;根據當前AAV衣殼蛋白序列的靶向性分數和產量分數的提升率之和、多樣性分數及預設最大降溫速率確定降溫速率;根據初始溫度和降溫速率確定當前溫度,根據目標函數選取當前溫度下第一預設數量的AAV衣殼蛋白序列繼續進行降溫優化,直至達到預設指標要求,停止降溫搜索;從所有滿足預設指標要求的AAV衣殼蛋白序列中選取第二預設數量的AAV衣殼蛋白序列進行聚類,以確定最終設計的AAV衣殼蛋白序列。本發明實施例能夠減少陷于局部最優解,提高AAV衣殼蛋白的靶向性和產量,可廣泛應用于生物信息技術領域。

          本發明授權一種AAV衣殼蛋白的設計方法、系統、裝置及存儲介質在權利要求書中公布了:1.一種AAV衣殼蛋白的設計方法,其特征在于,包括: 隨機初始化待優化的AAV衣殼蛋白序列,根據預設溫度設定初始溫度,初始溫度表征初始AAV序列各個位置的突變可能性; 根據當前AAV衣殼蛋白序列的靶向性分數和產量分數相比野生型AAV衣殼蛋白序列的提升率之和、當前AAV衣殼蛋白序列的多樣性分數及預設最大降溫速率確定降溫速率; 根據上一時刻溫度和降溫速率確定當前溫度,根據目標函數選取當前溫度下第一預設數量的AAV衣殼蛋白序列,繼續進行降溫優化,直至當前溫度下的AAV衣殼蛋白序列達到預設指標要求,停止降溫搜索;所述目標函數包括靶向性分數、產量分數和多樣性分數; 從所有滿足預設指標要求的AAV衣殼蛋白序列中選取第二預設數量的待定AAV衣殼蛋白序列,將待定AAV衣殼蛋白序列進行序列聚類,從每類序列中選取第三預設數量的AAV衣殼蛋白序列作為最終設計的AAV衣殼蛋白序列; AAV衣殼蛋白序列的多樣性分數通過以下步驟獲取: 獲取批量的AAV衣殼蛋白序列,根據AAV衣殼蛋白序列之間的相似度和覆蓋率對AAV衣殼蛋白序列進行聚類; 根據每類AAV衣殼蛋白序列中類總數量確定該類AAV衣殼蛋白序列的多樣性分數; AAV衣殼蛋白序列的多樣性分數通過以下公式計算得到: 根據當前AAV衣殼蛋白序列的靶向性分數和產量分數相比野生型AAV衣殼蛋白序列的提升率之和、當前AAV衣殼蛋白序列的多樣性分數及預設最大降溫速率確定降溫速率,具體包括: 根據當前AAV衣殼蛋白序列的靶向性分數與野生型AAV衣殼蛋白序列的靶向性分數確定第一提升率; 根據當前AAV衣殼蛋白序列的產量分數與野生型AAV衣殼蛋白序列的產量分數確定第二提升率; 根據第一提升率和第二提升率確定平均值,計算1與平均值的差值與當前AAV衣殼蛋白序列的多樣性分數的比值; 取比值與預設最大降溫速率概率中的較小值作為降溫速率。

          如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人清華珠三角研究院;賽業(廣州)生物科技有限公司,其通訊地址為:510530 廣東省廣州市黃埔區香雪八路98號(10)棟;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。

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